National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     72                                        
-     1,236                                        
?                                              
A     30                                        
C     21                                        
D     27                                        
E     21                                        
F     30                                        
G     33                                        
H     45                                        
I     87                                        
K     64                                        
L     257                   1                    
M     69                                        
N     39                                        
P     30                                        
Q     30                                        
R     30                                        
S     93                                        
T     81                                        
V     111                                        
W     6                                        
Y     60                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 18040 G 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 18041 C 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 18042 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 18043 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 18044 A 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 18045 A 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 18046 A 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 18047 A 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 18048 T 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 18049 G 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 18050 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 18051 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 18052 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 18053 C 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 18054 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 18055 G 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 18056 G 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 18057 A 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 18058 C 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 18059 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 18060 C 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 18061 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 18062 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 18063 T 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 18064 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 18065 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 18066 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 18067 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 18068 A 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 18069 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 18070 T 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 18071 G 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 18072 T 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 18073 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 18074 G 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 18075 T 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 18076 A 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 18077 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 18078 G 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 18079 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 18080 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 18081 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 18082 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 18083 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 18084 C 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 18085 A 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 18086 C 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 18087 T 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 18088 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 18089 G 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 18090 G 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 18091 T 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 18092 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 18093 A 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 18094 C 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 18095 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 18096 T 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 18097 C 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 18098 C 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 18099 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 18100 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 18101 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 18102 A 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 18103 C 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 18104 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 18105 G 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 18106 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 18107 C 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 18108 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 18109 C 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 18110 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 18111 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 18112 A 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 18113 C 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 18114 A 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 18115 C 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 18116 A 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 18117 C 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 18118 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 18119 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 18120 C 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 18121 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 18122 G 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 18123 T 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 18124 G 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 18125 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 18126 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 18127 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 18128 A 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 18129 C 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 18130 A 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 18131 C 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 18132 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 18133 A 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 18134 A 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 18135 A 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 18136 T 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 18137 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 18138 C 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 18139 A 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 18140 A 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 18141 A 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 18142 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 18143 C 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 18144 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 18145 G 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 18146 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 18147 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 18148 G 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 18149 G 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 18150 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 18151 T 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 18152 T 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 18153 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 18154 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 18155 G 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 18156 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 18157 G 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 18158 T 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 18159 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 18160 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 18161 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 18162 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 18163 A 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 18164 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 18165 A 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 18166 C 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 18167 C 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 18168 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 18169 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 18170 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 18171 C 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 18172 A 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 18173 T 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 18174 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 18175 C 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 18176 C 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 18177 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 18178 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 18179 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 18180 G 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 18181 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 18182 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 18183 C 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 18184 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 18185 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 18186 G 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 18187 A 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 18188 C 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 18189 C 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 18190 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 18191 A 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 18192 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 18193 A 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 18194 G 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 18195 A 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 18196 A 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 18197 G 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 18198 A 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 18199 C 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 18200 T 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 18201 C 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 18202 A 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 18203 T 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 18204 C 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 18205 T 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 18206 C 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 18207 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 18208 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 18209 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 18210 G 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 18211 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 18212 T 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 18213 G 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 18214 G 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 18215 G 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 18216 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 18217 T 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 18218 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 18219 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 18220 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 18221 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 18222 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 18223 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 18224 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 18225 G 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 18226 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 18227 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 18228 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 18229 T 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 18230 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 18231 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 18232 C 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 18233 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 18234 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 18235 G 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 18236 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 18237 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 18238 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 18239 A 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 18240 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 18241 G 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 18242 G 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 18243 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 18244 T 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 18245 A 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 18246 C 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 18247 C 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 18248 C 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 18249 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 18250 A 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 18251 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 18252 C 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 18253 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 18254 T 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 18255 G 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 18256 T 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 18257 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 18258 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 18259 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 18260 T 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 18261 C 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 18262 A 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 18263 C 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 18264 C 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 18265 C 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 18266 G 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 18267 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 18268 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 18269 A 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 18270 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 18271 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 18272 A 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 18273 A 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 18274 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 18275 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 18276 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 18277 A 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 18278 T 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 18279 A 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 18280 A 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 18281 G 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 18282 A 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 18283 C 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 18284 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 18285 T 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 18286 G 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 18287 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 18288 A 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 18289 C 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 18290 G 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 18291 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 18292 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 18293 C 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 18294 A 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 18295 T 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 18296 G 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 18297 G 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 18298 A 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 18299 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 18300 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 18301 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 18302 G 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 18303 C 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 18304 T 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 18305 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 18306 C 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 18307 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 18308 A 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 18309 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 18310 G 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 18311 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 18312 C 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 18313 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 18314 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 18315 G 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 18316 G 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 18317 G 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 18318 G 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 18319 T 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 18320 G 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 18321 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 18322 C 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 18323 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 18324 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 18325 G 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 18326 C 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 18327 T 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 18328 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 18329 C 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 18330 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 18331 A 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 18332 G 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 18333 A 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 18334 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 18335 A 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 18336 A 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 18337 G 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 18338 C 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 18339 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 18340 G 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 18341 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 18342 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 18343 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 18344 G 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 18345 T 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 18346 A 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 18347 C 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 18348 C 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 18349 A 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 18350 A 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 18351 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 18352 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 18353 T 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 18354 A 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 18355 C 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 18356 C 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 18357 T 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 18358 T 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 18359 T 1 1
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321 Antigua_and_Barbuda 18361 C 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 18362 A 1 1
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329 Antigua_and_Barbuda 18369 T 1 1
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331 Antigua_and_Barbuda 18371 T 1 1
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672 Antigua_and_Barbuda 18712 G 1 1
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674 Antigua_and_Barbuda 18714 C 1 1
675 Antigua_and_Barbuda 18715 T 1 1
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677 Antigua_and_Barbuda 18717 T 1 1
678 Antigua_and_Barbuda 18718 T 1 1
679 Antigua_and_Barbuda 18719 G 1 1
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