National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G I K L M N P R S T V Y
*     2                                  
-     228                                  
?                                        
A     12                                  
C     9                                  
D     3                                  
E     6                                  
F     15                                  
G     3                                  
I     9                                  
K     6                                  
L     43                                  
M     3                                  
N     15                                  
P     6                                  
R     9                                  
S     24                                  
T     12                                  
V     39                                  
Y     12                                  

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 26245 A 5 5
1 Brunei 26246 T 5 5
2 Brunei 26247 G 5 5
3 Brunei 26248 T 5 5
4 Brunei 26249 A 5 5
5 Brunei 26250 C 5 5
6 Brunei 26251 T 5 5
7 Brunei 26252 C 5 5
8 Brunei 26253 A 5 5
9 Brunei 26254 T 5 5
10 Brunei 26255 T 5 5
11 Brunei 26256 C 5 5
12 Brunei 26257 G 5 5
13 Brunei 26258 T 5 5
14 Brunei 26259 T 5 5
15 Brunei 26260 T 5 5
16 Brunei 26261 C 5 5
17 Brunei 26262 G 5 5
18 Brunei 26263 G 5 5
19 Brunei 26264 A 5 5
20 Brunei 26265 A 5 5
21 Brunei 26266 G 5 5
22 Brunei 26267 A 5 5
23 Brunei 26268 G 5 5
24 Brunei 26269 A 5 5
25 Brunei 26270 C 5 5
26 Brunei 26271 A 5 5
27 Brunei 26272 G 5 5
28 Brunei 26273 G 5 5
29 Brunei 26274 T 5 5
30 Brunei 26275 A 5 5
31 Brunei 26276 C 5 5
32 Brunei 26277 G 5 5
33 Brunei 26278 T 5 5
34 Brunei 26279 T 5 5
35 Brunei 26280 A 5 5
36 Brunei 26281 A 5 5
37 Brunei 26282 T 5 5
38 Brunei 26283 A 5 5
39 Brunei 26284 G 5 5
40 Brunei 26285 T 5 5
41 Brunei 26286 T 5 5
42 Brunei 26287 A 5 5
43 Brunei 26288 A 5 5
44 Brunei 26289 T 5 5
45 Brunei 26290 A 5 5
46 Brunei 26291 G 5 5
47 Brunei 26292 C 5 5
48 Brunei 26293 G 5 5
49 Brunei 26294 T 5 5
50 Brunei 26295 A 5 5
51 Brunei 26296 C 5 5
52 Brunei 26297 T 5 5
53 Brunei 26298 T 5 5
54 Brunei 26299 C 5 5
55 Brunei 26300 T 5 5
56 Brunei 26301 T 5 5
57 Brunei 26302 T 5 5
58 Brunei 26303 T 5 5
59 Brunei 26304 T 5 5
60 Brunei 26305 C 5 5
61 Brunei 26306 T 5 5
62 Brunei 26307 T 5 5
63 Brunei 26308 G 5 5
64 Brunei 26309 C 5 5
65 Brunei 26310 T 5 5
66 Brunei 26311 T 5 5
67 Brunei 26312 T 5 5
68 Brunei 26313 C 5 5
69 Brunei 26314 G 5 5
70 Brunei 26315 T 5 5
71 Brunei 26316 G 5 5
72 Brunei 26317 G 5 5
73 Brunei 26318 T 5 5
74 Brunei 26319 A 5 5
75 Brunei 26320 T 5 5
76 Brunei 26321 T 5 5
77 Brunei 26322 C 5 5
78 Brunei 26323 T 5 5
79 Brunei 26324 T 5 5
80 Brunei 26325 G 5 5
81 Brunei 26326 C 5 5
82 Brunei 26327 T 5 5
83 Brunei 26328 A 5 5
84 Brunei 26329 G 5 5
85 Brunei 26330 T 5 5
86 Brunei 26331 T 5 5
87 Brunei 26332 A 5 5
88 Brunei 26333 C 5 5
89 Brunei 26334 A 5 5
90 Brunei 26335 C 5 5
91 Brunei 26336 T 5 5
92 Brunei 26337 A 5 5
93 Brunei 26338 G 5 5
94 Brunei 26339 C 5 5
95 Brunei 26340 C 5 5
96 Brunei 26341 A 5 5
97 Brunei 26342 T 5 5
98 Brunei 26343 C 5 5
99 Brunei 26344 C 5 5
100 Brunei 26345 T 5 5
101 Brunei 26346 T 5 5
102 Brunei 26347 A 5 5
103 Brunei 26348 C 5 5
104 Brunei 26349 T 5 5
105 Brunei 26350 G 5 5
106 Brunei 26351 C 5 5
107 Brunei 26352 G 5 5
108 Brunei 26353 C 5 5
109 Brunei 26354 T 5 5
110 Brunei 26355 T 5 5
111 Brunei 26356 C 5 5
112 Brunei 26357 G 5 5
113 Brunei 26358 A 5 5
114 Brunei 26359 T 5 5
115 Brunei 26360 T 5 5
116 Brunei 26361 G 5 5
117 Brunei 26362 T 5 5
118 Brunei 26363 G 5 5
119 Brunei 26364 T 5 5
120 Brunei 26365 G 5 5
121 Brunei 26366 C 5 5
122 Brunei 26367 G 5 5
123 Brunei 26368 T 5 5
124 Brunei 26369 A 5 5
125 Brunei 26370 C 5 5
126 Brunei 26371 T 5 5
127 Brunei 26372 G 5 5
128 Brunei 26373 C 5 5
129 Brunei 26374 T 5 5
130 Brunei 26375 G 5 5
131 Brunei 26376 C 5 5
132 Brunei 26377 A 5 5
133 Brunei 26378 A 5 5
134 Brunei 26379 T 5 5
135 Brunei 26380 A 5 5
136 Brunei 26381 T 5 5
137 Brunei 26382 T 5 5
138 Brunei 26383 G 5 5
139 Brunei 26384 T 5 5
140 Brunei 26385 T 5 5
141 Brunei 26386 A 5 5
142 Brunei 26387 A 5 5
143 Brunei 26388 C 5 5
144 Brunei 26389 G 5 5
145 Brunei 26390 T 5 5
146 Brunei 26391 G 5 5
147 Brunei 26392 A 5 5
148 Brunei 26393 G 5 5
149 Brunei 26394 T 5 5
150 Brunei 26395 C 5 5
151 Brunei 26396 T 5 5
152 Brunei 26397 T 5 5
153 Brunei 26398 G 5 5
154 Brunei 26399 T 5 5
155 Brunei 26400 A 5 5
156 Brunei 26401 A 5 5
157 Brunei 26402 A 5 5
158 Brunei 26403 A 5 5
159 Brunei 26404 C 5 5
160 Brunei 26405 C 5 5
161 Brunei 26406 T 5 5
162 Brunei 26407 T 5 5
163 Brunei 26408 C 5 5
164 Brunei 26409 T 5 5
165 Brunei 26410 T 5 5
166 Brunei 26411 T 5 5
167 Brunei 26412 T 5 5
168 Brunei 26413 T 5 5
169 Brunei 26414 A 5 5
170 Brunei 26415 C 5 5
171 Brunei 26416 G 5 5
172 Brunei 26417 T 5 5
173 Brunei 26418 T 5 5
174 Brunei 26419 T 5 5
175 Brunei 26420 A 5 5
176 Brunei 26421 C 5 5
177 Brunei 26422 T 5 5
178 Brunei 26423 C 5 5
179 Brunei 26424 T 5 5
180 Brunei 26425 C 5 5
181 Brunei 26426 G 5 5
182 Brunei 26427 T 5 5
183 Brunei 26428 G 5 5
184 Brunei 26429 T 5 5
185 Brunei 26430 T 5 5
186 Brunei 26431 A 5 5
187 Brunei 26432 A 5 5
188 Brunei 26433 A 5 5
189 Brunei 26434 A 5 5
190 Brunei 26435 A 5 5
191 Brunei 26436 T 5 5
192 Brunei 26437 C 5 5
193 Brunei 26438 T 5 5
194 Brunei 26439 G 5 5
195 Brunei 26440 A 5 5
196 Brunei 26441 A 5 5
197 Brunei 26442 T 5 5
198 Brunei 26443 T 5 5
199 Brunei 26444 C 5 5
200 Brunei 26445 T 5 5
201 Brunei 26446 T 5 5
202 Brunei 26447 C 5 5
203 Brunei 26448 T 5 5
204 Brunei 26449 A 5 5
205 Brunei 26450 G 5 5
206 Brunei 26451 A 5 5
207 Brunei 26452 G 5 5
208 Brunei 26453 T 5 5
209 Brunei 26454 T 5 5
210 Brunei 26455 C 5 5
211 Brunei 26456 C 5 5
212 Brunei 26457 T 5 5
213 Brunei 26458 G 5 5
214 Brunei 26459 A 5 5
215 Brunei 26460 T 5 5
216 Brunei 26461 C 5 5
217 Brunei 26462 T 5 5
218 Brunei 26463 T 5 5
219 Brunei 26464 C 5 5
220 Brunei 26465 T 5 5
221 Brunei 26466 G 5 5
222 Brunei 26467 G 5 5
223 Brunei 26468 T 5 5
224 Brunei 26469 C 5 5
225 Brunei 26470 T 5 5
226 Brunei 26471 A 5 5
227 Brunei 26472 A 5 5