National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G I K L M N P R S T V Y
*     2                                  
-     228                                  
?                                        
A     12                                  
C     9                                  
D     3                                  
E     6                                  
F     15                                  
G     3                                  
I     9                                  
K     6                                  
L 1   43                       1          
M     3                                  
N     15                                  
P     6                                  
R     9                                  
S     24                                  
T     12                                  
V     39                                  
Y     12                                  

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Bosnia_and_Herzegovina 26245 A 33 33
1 Bosnia_and_Herzegovina 26246 T 33 33
2 Bosnia_and_Herzegovina 26247 G 33 33
3 Bosnia_and_Herzegovina 26248 T 33 33
4 Bosnia_and_Herzegovina 26249 A 33 33
5 Bosnia_and_Herzegovina 26250 C 33 33
6 Bosnia_and_Herzegovina 26251 T 33 33
7 Bosnia_and_Herzegovina 26252 C 33 33
8 Bosnia_and_Herzegovina 26253 A 33 33
9 Bosnia_and_Herzegovina 26254 T 33 33
10 Bosnia_and_Herzegovina 26255 T 33 33
11 Bosnia_and_Herzegovina 26256 C 33 33
12 Bosnia_and_Herzegovina 26257 G 33 33
13 Bosnia_and_Herzegovina 26258 T 33 33
14 Bosnia_and_Herzegovina 26259 T 33 33
15 Bosnia_and_Herzegovina 26260 T 33 33
16 Bosnia_and_Herzegovina 26261 C 33 33
17 Bosnia_and_Herzegovina 26262 G 33 33
18 Bosnia_and_Herzegovina 26263 G 33 33
19 Bosnia_and_Herzegovina 26264 A 33 33
20 Bosnia_and_Herzegovina 26265 A 33 33
21 Bosnia_and_Herzegovina 26266 G 33 33
22 Bosnia_and_Herzegovina 26267 A 33 33
23 Bosnia_and_Herzegovina 26268 G 33 33
24 Bosnia_and_Herzegovina 26269 A 33 33
25 Bosnia_and_Herzegovina 26270 C 33 33
26 Bosnia_and_Herzegovina 26271 A 33 33
27 Bosnia_and_Herzegovina 26272 G 33 33
28 Bosnia_and_Herzegovina 26273 G 33 33
29 Bosnia_and_Herzegovina 26274 T 33 33
30 Bosnia_and_Herzegovina 26275 A 33 33
31 Bosnia_and_Herzegovina 26276 C 33 33
32 Bosnia_and_Herzegovina 26277 G 33 33
33 Bosnia_and_Herzegovina 26278 T 33 33
34 Bosnia_and_Herzegovina 26279 T 33 33
35 Bosnia_and_Herzegovina 26280 A 33 33
36 Bosnia_and_Herzegovina 26281 A 33 33
37 Bosnia_and_Herzegovina 26282 T 33 33
38 Bosnia_and_Herzegovina 26283 A 33 33
39 Bosnia_and_Herzegovina 26284 G 33 33
40 Bosnia_and_Herzegovina 26285 T 33 33
41 Bosnia_and_Herzegovina 26286 T 33 33
42 Bosnia_and_Herzegovina 26287 A 33 33
43 Bosnia_and_Herzegovina 26288 A 33 33
44 Bosnia_and_Herzegovina 26289 T 33 33
45 Bosnia_and_Herzegovina 26290 A 33 33
46 Bosnia_and_Herzegovina 26291 G 33 33
47 Bosnia_and_Herzegovina 26292 C 33 33
48 Bosnia_and_Herzegovina 26293 G 33 33
49 Bosnia_and_Herzegovina 26294 T 33 33
50 Bosnia_and_Herzegovina 26295 A 33 33
51 Bosnia_and_Herzegovina 26296 C 33 33
52 Bosnia_and_Herzegovina 26297 T 33 33
53 Bosnia_and_Herzegovina 26298 T 33 33
54 Bosnia_and_Herzegovina 26299 C 33 33
55 Bosnia_and_Herzegovina 26300 T C 33 32 Leu19Pro
56 Bosnia_and_Herzegovina 26301 T 33 33
57 Bosnia_and_Herzegovina 26302 T 33 33
58 Bosnia_and_Herzegovina 26303 T 33 33
59 Bosnia_and_Herzegovina 26304 T 33 33
60 Bosnia_and_Herzegovina 26305 C 33 33
61 Bosnia_and_Herzegovina 26306 T 33 33
62 Bosnia_and_Herzegovina 26307 T 33 33
63 Bosnia_and_Herzegovina 26308 G 33 33
64 Bosnia_and_Herzegovina 26309 C 33 33
65 Bosnia_and_Herzegovina 26310 T 33 33
66 Bosnia_and_Herzegovina 26311 T 33 33
67 Bosnia_and_Herzegovina 26312 T 33 33
68 Bosnia_and_Herzegovina 26313 C 33 33
69 Bosnia_and_Herzegovina 26314 G 33 33
70 Bosnia_and_Herzegovina 26315 T 33 33
71 Bosnia_and_Herzegovina 26316 G 33 33
72 Bosnia_and_Herzegovina 26317 G 33 33
73 Bosnia_and_Herzegovina 26318 T 33 33
74 Bosnia_and_Herzegovina 26319 A 33 33
75 Bosnia_and_Herzegovina 26320 T 33 33
76 Bosnia_and_Herzegovina 26321 T 33 33
77 Bosnia_and_Herzegovina 26322 C 33 33
78 Bosnia_and_Herzegovina 26323 T 33 33
79 Bosnia_and_Herzegovina 26324 T A 33 32 Leu27*
80 Bosnia_and_Herzegovina 26325 G 33 33
81 Bosnia_and_Herzegovina 26326 C 33 33
82 Bosnia_and_Herzegovina 26327 T 33 33
83 Bosnia_and_Herzegovina 26328 A 33 33
84 Bosnia_and_Herzegovina 26329 G 33 33
85 Bosnia_and_Herzegovina 26330 T 33 33
86 Bosnia_and_Herzegovina 26331 T 33 33
87 Bosnia_and_Herzegovina 26332 A 33 33
88 Bosnia_and_Herzegovina 26333 C 33 33
89 Bosnia_and_Herzegovina 26334 A 33 33
90 Bosnia_and_Herzegovina 26335 C 33 33
91 Bosnia_and_Herzegovina 26336 T 33 33
92 Bosnia_and_Herzegovina 26337 A 33 33
93 Bosnia_and_Herzegovina 26338 G 33 33
94 Bosnia_and_Herzegovina 26339 C 33 33
95 Bosnia_and_Herzegovina 26340 C 33 33
96 Bosnia_and_Herzegovina 26341 A 33 33
97 Bosnia_and_Herzegovina 26342 T 33 33
98 Bosnia_and_Herzegovina 26343 C 33 33
99 Bosnia_and_Herzegovina 26344 C 33 33
100 Bosnia_and_Herzegovina 26345 T 33 33
101 Bosnia_and_Herzegovina 26346 T 33 33
102 Bosnia_and_Herzegovina 26347 A 33 33
103 Bosnia_and_Herzegovina 26348 C 33 33
104 Bosnia_and_Herzegovina 26349 T 33 33
105 Bosnia_and_Herzegovina 26350 G 33 33
106 Bosnia_and_Herzegovina 26351 C 33 33
107 Bosnia_and_Herzegovina 26352 G 33 33
108 Bosnia_and_Herzegovina 26353 C 33 33
109 Bosnia_and_Herzegovina 26354 T 33 33
110 Bosnia_and_Herzegovina 26355 T 33 33
111 Bosnia_and_Herzegovina 26356 C 33 33
112 Bosnia_and_Herzegovina 26357 G 33 33
113 Bosnia_and_Herzegovina 26358 A 33 33
114 Bosnia_and_Herzegovina 26359 T 33 33
115 Bosnia_and_Herzegovina 26360 T 33 33
116 Bosnia_and_Herzegovina 26361 G 33 33
117 Bosnia_and_Herzegovina 26362 T 33 33
118 Bosnia_and_Herzegovina 26363 G 33 33
119 Bosnia_and_Herzegovina 26364 T 33 33
120 Bosnia_and_Herzegovina 26365 G 33 33
121 Bosnia_and_Herzegovina 26366 C 33 33
122 Bosnia_and_Herzegovina 26367 G 33 33
123 Bosnia_and_Herzegovina 26368 T 33 33
124 Bosnia_and_Herzegovina 26369 A 33 33
125 Bosnia_and_Herzegovina 26370 C 33 33
126 Bosnia_and_Herzegovina 26371 T 33 33
127 Bosnia_and_Herzegovina 26372 G 33 33
128 Bosnia_and_Herzegovina 26373 C 33 33
129 Bosnia_and_Herzegovina 26374 T 33 33
130 Bosnia_and_Herzegovina 26375 G 33 33
131 Bosnia_and_Herzegovina 26376 C 33 33
132 Bosnia_and_Herzegovina 26377 A 33 33
133 Bosnia_and_Herzegovina 26378 A 33 33
134 Bosnia_and_Herzegovina 26379 T 33 33
135 Bosnia_and_Herzegovina 26380 A 33 33
136 Bosnia_and_Herzegovina 26381 T 33 33
137 Bosnia_and_Herzegovina 26382 T 33 33
138 Bosnia_and_Herzegovina 26383 G 33 33
139 Bosnia_and_Herzegovina 26384 T 33 33
140 Bosnia_and_Herzegovina 26385 T 33 33
141 Bosnia_and_Herzegovina 26386 A 33 33
142 Bosnia_and_Herzegovina 26387 A 33 33
143 Bosnia_and_Herzegovina 26388 C 33 33
144 Bosnia_and_Herzegovina 26389 G 33 33
145 Bosnia_and_Herzegovina 26390 T 33 33
146 Bosnia_and_Herzegovina 26391 G 33 33
147 Bosnia_and_Herzegovina 26392 A 33 33
148 Bosnia_and_Herzegovina 26393 G 33 33
149 Bosnia_and_Herzegovina 26394 T 33 33
150 Bosnia_and_Herzegovina 26395 C 33 33
151 Bosnia_and_Herzegovina 26396 T 33 33
152 Bosnia_and_Herzegovina 26397 T 33 33
153 Bosnia_and_Herzegovina 26398 G 33 33
154 Bosnia_and_Herzegovina 26399 T 33 33
155 Bosnia_and_Herzegovina 26400 A 33 33
156 Bosnia_and_Herzegovina 26401 A 33 33
157 Bosnia_and_Herzegovina 26402 A 33 33
158 Bosnia_and_Herzegovina 26403 A 33 33
159 Bosnia_and_Herzegovina 26404 C 33 33
160 Bosnia_and_Herzegovina 26405 C 33 33
161 Bosnia_and_Herzegovina 26406 T 33 33
162 Bosnia_and_Herzegovina 26407 T 33 33
163 Bosnia_and_Herzegovina 26408 C 33 33
164 Bosnia_and_Herzegovina 26409 T 33 33
165 Bosnia_and_Herzegovina 26410 T 33 33
166 Bosnia_and_Herzegovina 26411 T 33 33
167 Bosnia_and_Herzegovina 26412 T 33 33
168 Bosnia_and_Herzegovina 26413 T 33 33
169 Bosnia_and_Herzegovina 26414 A 33 33
170 Bosnia_and_Herzegovina 26415 C 33 33
171 Bosnia_and_Herzegovina 26416 G 33 33
172 Bosnia_and_Herzegovina 26417 T 33 33
173 Bosnia_and_Herzegovina 26418 T 33 33
174 Bosnia_and_Herzegovina 26419 T 33 33
175 Bosnia_and_Herzegovina 26420 A 33 33
176 Bosnia_and_Herzegovina 26421 C 33 33
177 Bosnia_and_Herzegovina 26422 T 33 33
178 Bosnia_and_Herzegovina 26423 C 33 33
179 Bosnia_and_Herzegovina 26424 T 33 33
180 Bosnia_and_Herzegovina 26425 C 33 33
181 Bosnia_and_Herzegovina 26426 G 33 33
182 Bosnia_and_Herzegovina 26427 T 33 33
183 Bosnia_and_Herzegovina 26428 G 33 33
184 Bosnia_and_Herzegovina 26429 T 33 33
185 Bosnia_and_Herzegovina 26430 T 33 33
186 Bosnia_and_Herzegovina 26431 A 33 33
187 Bosnia_and_Herzegovina 26432 A 33 33
188 Bosnia_and_Herzegovina 26433 A 33 33
189 Bosnia_and_Herzegovina 26434 A 33 33
190 Bosnia_and_Herzegovina 26435 A 33 33
191 Bosnia_and_Herzegovina 26436 T 33 33
192 Bosnia_and_Herzegovina 26437 C 33 33
193 Bosnia_and_Herzegovina 26438 T 33 33
194 Bosnia_and_Herzegovina 26439 G 33 33
195 Bosnia_and_Herzegovina 26440 A 33 33
196 Bosnia_and_Herzegovina 26441 A 33 33
197 Bosnia_and_Herzegovina 26442 T 33 33
198 Bosnia_and_Herzegovina 26443 T 33 33
199 Bosnia_and_Herzegovina 26444 C 33 33
200 Bosnia_and_Herzegovina 26445 T 33 32
201 Bosnia_and_Herzegovina 26446 T 33 33
202 Bosnia_and_Herzegovina 26447 C 33 33
203 Bosnia_and_Herzegovina 26448 T 33 33
204 Bosnia_and_Herzegovina 26449 A 33 33
205 Bosnia_and_Herzegovina 26450 G 33 33
206 Bosnia_and_Herzegovina 26451 A 33 33
207 Bosnia_and_Herzegovina 26452 G 33 33
208 Bosnia_and_Herzegovina 26453 T 33 33
209 Bosnia_and_Herzegovina 26454 T 33 33
210 Bosnia_and_Herzegovina 26455 C 33 33
211 Bosnia_and_Herzegovina 26456 C 33 33
212 Bosnia_and_Herzegovina 26457 T 33 33
213 Bosnia_and_Herzegovina 26458 G 33 33
214 Bosnia_and_Herzegovina 26459 A 33 33
215 Bosnia_and_Herzegovina 26460 T 33 33
216 Bosnia_and_Herzegovina 26461 C 33 33
217 Bosnia_and_Herzegovina 26462 T 33 33
218 Bosnia_and_Herzegovina 26463 T 33 33
219 Bosnia_and_Herzegovina 26464 C 33 33
220 Bosnia_and_Herzegovina 26465 T 33 33
221 Bosnia_and_Herzegovina 26466 G 33 33
222 Bosnia_and_Herzegovina 26467 G 33 33
223 Bosnia_and_Herzegovina 26468 T 33 33
224 Bosnia_and_Herzegovina 26469 C 33 33
225 Bosnia_and_Herzegovina 26470 T 33 33
226 Bosnia_and_Herzegovina 26471 A 33 33
227 Bosnia_and_Herzegovina 26472 A 33 33