National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G I K L M N P R S T V Y
*     2                                  
-     228                                  
?                                        
A     12                                  
C     9                                  
D     3                                  
E     6                                  
F     15                                  
G     3                                  
I     9                                  
K     6                                  
L     43                                  
M     3                                  
N     15                                  
P     6                                  
R     9                                  
S     24                                  
T     12                                  
V     39                                  
Y     12                                  

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 26245 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 26246 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 26247 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 26248 T 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 26249 A 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 26250 C 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 26251 T 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 26252 C 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 26253 A 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 26254 T 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 26255 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 26256 C 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 26257 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 26258 T 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 26259 T 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 26260 T 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 26261 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 26262 G 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 26263 G 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 26264 A 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 26265 A 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 26266 G 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 26267 A 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 26268 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 26269 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 26270 C 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 26271 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 26272 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 26273 G 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 26274 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 26275 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 26276 C 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 26277 G 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 26278 T 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 26279 T 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 26280 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 26281 A 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 26282 T 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 26283 A 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 26284 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 26285 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 26286 T 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 26287 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 26288 A 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 26289 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 26290 A 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 26291 G 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 26292 C 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 26293 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 26294 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 26295 A 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 26296 C 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 26297 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 26298 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 26299 C 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 26300 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 26301 T 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 26302 T 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 26303 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 26304 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 26305 C 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 26306 T 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 26307 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 26308 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 26309 C 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 26310 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 26311 T 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 26312 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 26313 C 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 26314 G 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 26315 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 26316 G 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 26317 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 26318 T 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 26319 A 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 26320 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 26321 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 26322 C 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 26323 T 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 26324 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 26325 G 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 26326 C 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 26327 T 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 26328 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 26329 G 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 26330 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 26331 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 26332 A 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 26333 C 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 26334 A 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 26335 C 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 26336 T 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 26337 A 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 26338 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 26339 C 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 26340 C 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 26341 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 26342 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 26343 C 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 26344 C 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 26345 T 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 26346 T 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 26347 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 26348 C 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 26349 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 26350 G 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 26351 C 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 26352 G 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 26353 C 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 26354 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 26355 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 26356 C 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 26357 G 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 26358 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 26359 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 26360 T 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 26361 G 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 26362 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 26363 G 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 26364 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 26365 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 26366 C 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 26367 G 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 26368 T 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 26369 A 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 26370 C 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 26371 T 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 26372 G 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 26373 C 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 26374 T 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 26375 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 26376 C 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 26377 A 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 26378 A 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 26379 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 26380 A 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 26381 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 26382 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 26383 G 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 26384 T 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 26385 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 26386 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 26387 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 26388 C 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 26389 G 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 26390 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 26391 G 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 26392 A 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 26393 G 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 26394 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 26395 C 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 26396 T 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 26397 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 26398 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 26399 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 26400 A 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 26401 A 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 26402 A 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 26403 A 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 26404 C 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 26405 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 26406 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 26407 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 26408 C 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 26409 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 26410 T 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 26411 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 26412 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 26413 T 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 26414 A 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 26415 C 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 26416 G 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 26417 T 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 26418 T 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 26419 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 26420 A 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 26421 C 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 26422 T 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 26423 C 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 26424 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 26425 C 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 26426 G 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 26427 T 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 26428 G 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 26429 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 26430 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 26431 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 26432 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 26433 A 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 26434 A 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 26435 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 26436 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 26437 C 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 26438 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 26439 G 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 26440 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 26441 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 26442 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 26443 T 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 26444 C 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 26445 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 26446 T 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 26447 C 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 26448 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 26449 A 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 26450 G 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 26451 A 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 26452 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 26453 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 26454 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 26455 C 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 26456 C 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 26457 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 26458 G 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 26459 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 26460 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 26461 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 26462 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 26463 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 26464 C 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 26465 T 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 26466 G 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 26467 G 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 26468 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 26469 C 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 26470 T 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 26471 A 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 26472 A 1 1