National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     75                   2                 2 1
-     1,038                                        
?                                              
A     9                                        
C     9                                        
D     9                                        
E     21                                        
F     39                                        
G 1   15                                        
H     36                             1         2
I     69                                        
K     87                       1     1          
L     207         1         2           1        
M     60                                        
N     62             1                          
P     21                   1           1        
Q     39                                        
R     31                 1 1                    
S     57                                        
T     42               1               1        
V     87 1             1                        
W     18                   1                    
Y     45                                       1

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Nigeria 19621 A 234 234
1 Nigeria 19622 G 234 234
2 Nigeria 19623 T 235 235
3 Nigeria 19624 T 235 235
4 Nigeria 19625 T 235 235
5 Nigeria 19626 A 235 235
6 Nigeria 19627 G 235 235
7 Nigeria 19628 A 235 235
8 Nigeria 19629 A 235 235
9 Nigeria 19630 A 235 235
10 Nigeria 19631 A 235 235
11 Nigeria 19632 T 235 235
12 Nigeria 19633 G 235 235
13 Nigeria 19634 T 235 235
14 Nigeria 19635 G 235 235
15 Nigeria 19636 G 235 235
16 Nigeria 19637 C 237 237
17 Nigeria 19638 T 237 237
18 Nigeria 19639 T 237 237
19 Nigeria 19640 T 237 237
20 Nigeria 19641 T 237 237
21 Nigeria 19642 A 237 237
22 Nigeria 19643 A 237 237
23 Nigeria 19644 T 237 237
24 Nigeria 19645 G 237 237
25 Nigeria 19646 T 237 237
26 Nigeria 19647 T 237 237
27 Nigeria 19648 G 237 237
28 Nigeria 19649 T 237 237
29 Nigeria 19650 A 237 237
30 Nigeria 19651 A 237 237
31 Nigeria 19652 A 237 237
32 Nigeria 19653 T 237 237
33 Nigeria 19654 A 237 237
34 Nigeria 19655 A 237 237
35 Nigeria 19656 G A 237 236 Arg6464Lys
36 Nigeria 19657 G 237 237
37 Nigeria 19658 G 237 237
38 Nigeria 19659 A 237 237
39 Nigeria 19660 C 238 237
40 Nigeria 19661 A 238 236
41 Nigeria 19662 C 238 236
42 Nigeria 19663 T 238 236
43 Nigeria 19664 T 238 236
44 Nigeria 19665 T 238 236
45 Nigeria 19666 G 238 236
46 Nigeria 19667 A 238 236
47 Nigeria 19668 T 238 236
48 Nigeria 19669 G 238 235
49 Nigeria 19670 G 238 235
50 Nigeria 19671 A 238 236
51 Nigeria 19672 C 238 237
52 Nigeria 19673 A 238 237
53 Nigeria 19674 A 238 237
54 Nigeria 19675 C 238 237
55 Nigeria 19676 A 238 237
56 Nigeria 19677 G 238 236
57 Nigeria 19678 G 238 237
58 Nigeria 19679 G 239 238
59 Nigeria 19680 T 239 238
60 Nigeria 19681 G 239 238
61 Nigeria 19682 A 240 239
62 Nigeria 19683 A 240 239
63 Nigeria 19684 G 240 239
64 Nigeria 19685 T 240 239
65 Nigeria 19686 A 240 239
66 Nigeria 19687 C 240 239
67 Nigeria 19688 C 240 239
68 Nigeria 19689 A 240 239
69 Nigeria 19690 G 240 239
70 Nigeria 19691 T 240 239
71 Nigeria 19692 T 240 240
72 Nigeria 19693 T 240 240
73 Nigeria 19694 C 240 240
74 Nigeria 19695 T 239 239
75 Nigeria 19696 A 239 239
76 Nigeria 19697 T 239 239
77 Nigeria 19698 C 239 239
78 Nigeria 19699 A 240 239
79 Nigeria 19700 T 240 239
80 Nigeria 19701 T 240 239
81 Nigeria 19702 A 240 239
82 Nigeria 19703 A 240 239
83 Nigeria 19704 T 240 239
84 Nigeria 19705 A 240 240
85 Nigeria 19706 A 240 240
86 Nigeria 19707 C 240 240
87 Nigeria 19708 A 240 240
88 Nigeria 19709 C 240 240
89 Nigeria 19710 T 240 239
90 Nigeria 19711 G 240 239
91 Nigeria 19712 T 240 239
92 Nigeria 19713 T 240 239
93 Nigeria 19714 T 240 239
94 Nigeria 19715 A 240 239
95 Nigeria 19716 C 240 239
96 Nigeria 19717 A 240 239
97 Nigeria 19718 C 240 239
98 Nigeria 19719 A 240 239
99 Nigeria 19720 A 240 240
100 Nigeria 19721 A 240 240
101 Nigeria 19722 A 240 240
102 Nigeria 19723 G T 240 239 Lys6486Asn
103 Nigeria 19724 T 240 240
104 Nigeria 19725 T 240 239
105 Nigeria 19726 G 240 239
106 Nigeria 19727 A 240 239
107 Nigeria 19728 T 240 239
108 Nigeria 19729 G 240 239
109 Nigeria 19730 G 240 239
110 Nigeria 19731 T 240 239
111 Nigeria 19732 G 240 239
112 Nigeria 19733 T 240 239
113 Nigeria 19734 T 240 239
114 Nigeria 19735 G 240 239
115 Nigeria 19736 A 240 240
116 Nigeria 19737 T 240 240
117 Nigeria 19738 G 240 240
118 Nigeria 19739 T 240 240
119 Nigeria 19740 A 240 240
120 Nigeria 19741 G 240 240
121 Nigeria 19742 A 240 240
122 Nigeria 19743 A 240 240
123 Nigeria 19744 T 240 240
124 Nigeria 19745 T 240 240
125 Nigeria 19746 G 240 240
126 Nigeria 19747 T 240 239
127 Nigeria 19748 T 240 239
128 Nigeria 19749 T 240 239
129 Nigeria 19750 G 240 239
130 Nigeria 19751 A 240 239
131 Nigeria 19752 A 240 238
132 Nigeria 19753 A 240 238
133 Nigeria 19754 A 241 239
134 Nigeria 19755 T 241 239
135 Nigeria 19756 A 241 239
136 Nigeria 19757 A 241 239
137 Nigeria 19758 A 241 239
138 Nigeria 19759 A 241 239
139 Nigeria 19760 C 241 239
140 Nigeria 19761 A 241 239
141 Nigeria 19762 A 241 239
142 Nigeria 19763 C 241 239
143 Nigeria 19764 A 241 238
144 Nigeria 19765 T 241 238
145 Nigeria 19766 T 241 238
146 Nigeria 19767 A 241 238
147 Nigeria 19768 C 241 238
148 Nigeria 19769 C 241 238
149 Nigeria 19770 T 241 238
150 Nigeria 19771 G 241 239
151 Nigeria 19772 T 241 239
152 Nigeria 19773 T 241 239
153 Nigeria 19774 A 241 239
154 Nigeria 19775 A 241 239
155 Nigeria 19776 T 241 239
156 Nigeria 19777 G 241 239
157 Nigeria 19778 T 241 239
158 Nigeria 19779 A 241 238
159 Nigeria 19780 G 241 239
160 Nigeria 19781 C 241 239
161 Nigeria 19782 A G 241 238 His6506Arg
162 Nigeria 19783 T 241 239
163 Nigeria 19784 T 241 238
164 Nigeria 19785 T 241 238
165 Nigeria 19786 G 241 238
166 Nigeria 19787 A 241 238
167 Nigeria 19788 G 241 238
168 Nigeria 19789 C 241 239
169 Nigeria 19790 T 241 238
170 Nigeria 19791 T 241 238
171 Nigeria 19792 T 241 238
172 Nigeria 19793 G 241 239
173 Nigeria 19794 G 241 239
174 Nigeria 19795 G 241 238
175 Nigeria 19796 C 241 239
176 Nigeria 19797 T 241 239
177 Nigeria 19798 A 241 239
178 Nigeria 19799 A 241 239
179 Nigeria 19800 G 241 239
180 Nigeria 19801 C 241 239
181 Nigeria 19802 G 241 239
182 Nigeria 19803 C 241 239
183 Nigeria 19804 A 241 239
184 Nigeria 19805 A 241 239
185 Nigeria 19806 C 242 240
186 Nigeria 19807 A 242 240
187 Nigeria 19808 T 242 241
188 Nigeria 19809 T 242 241
189 Nigeria 19810 A 242 241
190 Nigeria 19811 A 242 241
191 Nigeria 19812 A 242 239
192 Nigeria 19813 C 242 240
193 Nigeria 19814 C 242 240
194 Nigeria 19815 A 242 240
195 Nigeria 19816 G 242 240
196 Nigeria 19817 T 242 240
197 Nigeria 19818 A 242 240
198 Nigeria 19819 C 242 240
199 Nigeria 19820 C 242 240
200 Nigeria 19821 A 242 240
201 Nigeria 19822 G 242 240
202 Nigeria 19823 A 242 240
203 Nigeria 19824 G 242 240
204 Nigeria 19825 G 243 241
205 Nigeria 19826 T 243 241
206 Nigeria 19827 G 243 241
207 Nigeria 19828 A 243 241
208 Nigeria 19829 A 244 242
209 Nigeria 19830 A 244 242
210 Nigeria 19831 A 244 242
211 Nigeria 19832 T 244 242
212 Nigeria 19833 A 244 242
213 Nigeria 19834 C 244 242
214 Nigeria 19835 T 244 243
215 Nigeria 19836 C 244 243
216 Nigeria 19837 A 244 243
217 Nigeria 19838 A 244 243
218 Nigeria 19839 T 244 243
219 Nigeria 19840 A 244 243
220 Nigeria 19841 A 244 243
221 Nigeria 19842 T 244 243
222 Nigeria 19843 T 244 243
223 Nigeria 19844 T 244 243
224 Nigeria 19845 G 244 243
225 Nigeria 19846 G 244 243
226 Nigeria 19847 G 244 243
227 Nigeria 19848 T 244 243
228 Nigeria 19849 G 244 243
229 Nigeria 19850 T 244 243
230 Nigeria 19851 G 244 244
231 Nigeria 19852 G 244 244
232 Nigeria 19853 A 244 244
233 Nigeria 19854 C 244 244
234 Nigeria 19855 A 244 243
235 Nigeria 19856 T 244 243
236 Nigeria 19857 T 244 243
237 Nigeria 19858 G 244 243
238 Nigeria 19859 C 244 243
239 Nigeria 19860 T 244 243
240 Nigeria 19861 G 244 244
241 Nigeria 19862 C 244 244
242 Nigeria 19863 T 244 244
243 Nigeria 19864 A 244 244
244 Nigeria 19865 A 244 244
245 Nigeria 19866 T 244 244
246 Nigeria 19867 A 244 244
247 Nigeria 19868 C T 244 243 Leu6535Leu
248 Nigeria 19869 T 244 243
249 Nigeria 19870 G 244 243
250 Nigeria 19871 T 244 243
251 Nigeria 19872 G 244 243
252 Nigeria 19873 A 244 243
253 Nigeria 19874 T 244 243
254 Nigeria 19875 C 244 243
255 Nigeria 19876 T 244 243
256 Nigeria 19877 G 244 243
257 Nigeria 19878 G 244 243
258 Nigeria 19879 G 244 242
259 Nigeria 19880 A 244 243
260 Nigeria 19881 C 244 244
261 Nigeria 19882 T 244 244
262 Nigeria 19883 A 244 244
263 Nigeria 19884 C 245 245
264 Nigeria 19885 A 245 245
265 Nigeria 19886 A 245 245
266 Nigeria 19887 A 245 245
267 Nigeria 19888 A 245 245
268 Nigeria 19889 G 245 245
269 Nigeria 19890 A 245 245
270 Nigeria 19891 G 245 245
271 Nigeria 19892 A 245 245
272 Nigeria 19893 T 245 245
273 Nigeria 19894 G 245 245
274 Nigeria 19895 C T 245 244 Leu6544Phe
275 Nigeria 19896 T 245 244
276 Nigeria 19897 C 245 244
277 Nigeria 19898 C 245 244
278 Nigeria 19899 A 245 244
279 Nigeria 19900 G 245 244
280 Nigeria 19901 C 245 244
281 Nigeria 19902 A 245 244
282 Nigeria 19903 C 245 245
283 Nigeria 19904 A 245 244
284 Nigeria 19905 T 245 244
285 Nigeria 19906 A 245 243
286 Nigeria 19907 T 245 243
287 Nigeria 19908 A 245 243
288 Nigeria 19909 T 245 243
289 Nigeria 19910 C 245 243
290 Nigeria 19911 T 245 243
291 Nigeria 19912 A 242 240
292 Nigeria 19913 C 242 240
293 Nigeria 19914 T 242 241
294 Nigeria 19915 A 242 241
295 Nigeria 19916 T 242 241
296 Nigeria 19917 T 241 240
297 Nigeria 19918 G 241 240
298 Nigeria 19919 G 241 240
299 Nigeria 19920 T 241 240
300 Nigeria 19921 G 241 240
301 Nigeria 19922 T 241 240
302 Nigeria 19923 T 241 240
303 Nigeria 19924 T 241 240
304 Nigeria 19925 G 241 240
305 Nigeria 19926 T 241 239
306 Nigeria 19927 T 241 239
307 Nigeria 19928 C 241 239
308 Nigeria 19929 T 241 239
309 Nigeria 19930 A 241 239
310 Nigeria 19931 T 242 240
311 Nigeria 19932 G 242 241
312 Nigeria 19933 A 242 241
313 Nigeria 19934 C 242 241
314 Nigeria 19935 T 242 240
315 Nigeria 19936 G 242 240
316 Nigeria 19937 A 242 240
317 Nigeria 19938 C 242 240
318 Nigeria 19939 A 242 240
319 Nigeria 19940 T 242 240
320 Nigeria 19941 A 242 240
321 Nigeria 19942 G 242 240
322 Nigeria 19943 C 242 240
323 Nigeria 19944 C 242 240
324 Nigeria 19945 A 242 240
325 Nigeria 19946 A 242 240
326 Nigeria 19947 G 242 240
327 Nigeria 19948 A 242 240
328 Nigeria 19949 A 242 240
329 Nigeria 19950 A 242 240
330 Nigeria 19951 C 242 240
331 Nigeria 19952 C 242 240
332 Nigeria 19953 A 242 240
333 Nigeria 19954 A 242 240
334 Nigeria 19955 C 242 240
335 Nigeria 19956 T 242 240
336 Nigeria 19957 G 242 240
337 Nigeria 19958 A 242 240
338 Nigeria 19959 A 242 240
339 Nigeria 19960 A 242 240
340 Nigeria 19961 C 242 240
341 Nigeria 19962 G T 242 239 Arg6566Leu
342 Nigeria 19963 A 242 240
343 Nigeria 19964 T 242 240
344 Nigeria 19965 T 242 240
345 Nigeria 19966 T 242 240
346 Nigeria 19967 G 242 240
347 Nigeria 19968 T 242 240
348 Nigeria 19969 G 242 241
349 Nigeria 19970 C 242 241
350 Nigeria 19971 A 242 241
351 Nigeria 19972 C 242 241
352 Nigeria 19973 C T 242 240 His6570Tyr
353 Nigeria 19974 A 242 241
354 Nigeria 19975 C 242 241
355 Nigeria 19976 T 242 241
356 Nigeria 19977 C 243 243
357 Nigeria 19978 A 243 243
358 Nigeria 19979 C 243 243
359 Nigeria 19980 T 243 243
360 Nigeria 19981 G 243 243
361 Nigeria 19982 T 243 242
362 Nigeria 19983 C 243 242
363 Nigeria 19984 T 243 242
364 Nigeria 19985 T 243 242
365 Nigeria 19986 T 243 243
366 Nigeria 19987 T 243 243
367 Nigeria 19988 T 243 243
368 Nigeria 19989 T 243 243
369 Nigeria 19990 G 243 243
370 Nigeria 19991 A 243 243
371 Nigeria 19992 T 243 243
372 Nigeria 19993 G 243 243
373 Nigeria 19994 G 243 243
374 Nigeria 19995 T 243 243
375 Nigeria 19996 A 243 243
376 Nigeria 19997 G 243 243
377 Nigeria 19998 A 243 243
378 Nigeria 19999 G 243 243
379 Nigeria 20000 T 243 243
380 Nigeria 20001 T 243 243
381 Nigeria 20002 G 243 243
382 Nigeria 20003 A 243 243
383 Nigeria 20004 T 243 242
384 Nigeria 20005 G 243 242
385 Nigeria 20006 G 243 242
386 Nigeria 20007 T 243 242
387 Nigeria 20008 C 242 241
388 Nigeria 20009 A 242 242
389 Nigeria 20010 A 242 242
390 Nigeria 20011 G 242 242
391 Nigeria 20012 T 242 242
392 Nigeria 20013 A 242 242
393 Nigeria 20014 G T 242 241 Ter6583Tyrext*?
394 Nigeria 20015 A 242 242
395 Nigeria 20016 C 242 242
396 Nigeria 20017 T 242 241
397 Nigeria 20018 T 242 241
398 Nigeria 20019 A 242 242
399 Nigeria 20020 T 242 241
400 Nigeria 20021 T 242 241
401 Nigeria 20022 T 242 241
402 Nigeria 20023 A 241 240
403 Nigeria 20024 G 241 240
404 Nigeria 20025 A 241 241
405 Nigeria 20026 A 241 241
406 Nigeria 20027 A 241 241
407 Nigeria 20028 T 240 240
408 Nigeria 20029 G 240 240
409 Nigeria 20030 C 240 240
410 Nigeria 20031 C 240 240
411 Nigeria 20032 C 240 240
412 Nigeria 20033 G 240 240
413 Nigeria 20034 T 240 240
414 Nigeria 20035 A 240 240
415 Nigeria 20036 A 240 240
416 Nigeria 20037 T 240 240
417 Nigeria 20038 G 240 240
418 Nigeria 20039 G 240 240
419 Nigeria 20040 T 240 240
420 Nigeria 20041 G 240 240
421 Nigeria 20042 T 240 240
422 Nigeria 20043 T 240 239
423 Nigeria 20044 C 240 239
424 Nigeria 20045 T 240 239
425 Nigeria 20046 T 240 239
426 Nigeria 20047 A 240 238
427 Nigeria 20048 T 240 238
428 Nigeria 20049 T 240 240
429 Nigeria 20050 A 240 240
430 Nigeria 20051 C 240 240
431 Nigeria 20052 A 238 236
432 Nigeria 20053 G 238 237
433 Nigeria 20054 A 238 237
434 Nigeria 20055 A G 238 236 Lys6597Arg
435 Nigeria 20056 G 238 237
436 Nigeria 20057 G 238 237
437 Nigeria 20058 T 238 237
438 Nigeria 20059 A 238 237
439 Nigeria 20060 G 238 237
440 Nigeria 20061 T 238 237
441 Nigeria 20062 G 238 237
442 Nigeria 20063 T 238 237
443 Nigeria 20064 T 238 237
444 Nigeria 20065 A 238 237
445 Nigeria 20066 A 238 237
446 Nigeria 20067 A 238 237
447 Nigeria 20068 G 238 237
448 Nigeria 20069 G 238 237
449 Nigeria 20070 T 238 235
450 Nigeria 20071 T 238 236
451 Nigeria 20072 T 238 235
452 Nigeria 20073 A 238 235
453 Nigeria 20074 C 238 235
454 Nigeria 20075 A 238 235
455 Nigeria 20076 A 238 235
456 Nigeria 20077 C 238 235
457 Nigeria 20078 C 237 234
458 Nigeria 20079 A 237 234
459 Nigeria 20080 T 237 235
460 Nigeria 20081 C T 236 227 Leu6606Leu
461 Nigeria 20082 T 236 234
462 Nigeria 20083 G 236 234
463 Nigeria 20084 T 236 235
464 Nigeria 20085 A 236 234
465 Nigeria 20086 G 236 235
466 Nigeria 20087 G 236 234
467 Nigeria 20088 T 236 233
468 Nigeria 20089 C 236 233
469 Nigeria 20090 C 236 233
470 Nigeria 20091 C 236 233
471 Nigeria 20092 A 236 233
472 Nigeria 20093 A 236 233
473 Nigeria 20094 A 236 233
474 Nigeria 20095 C 237 234
475 Nigeria 20096 A 237 234
476 Nigeria 20097 A 237 234
477 Nigeria 20098 G 237 234
478 Nigeria 20099 C 237 234
479 Nigeria 20100 T 237 233
480 Nigeria 20101 A 237 233
481 Nigeria 20102 G 237 233
482 Nigeria 20103 T C 237 230 Val6613Ala
483 Nigeria 20104 C 237 233
484 Nigeria 20105 T 237 233
485 Nigeria 20106 T 236 233
486 Nigeria 20107 A 236 233
487 Nigeria 20108 A 236 233
488 Nigeria 20109 T 236 233
489 Nigeria 20110 G 236 233
490 Nigeria 20111 G 236 233
491 Nigeria 20112 A 236 234
492 Nigeria 20113 G 237 235
493 Nigeria 20114 T 237 234
494 Nigeria 20115 C 237 235
495 Nigeria 20116 A 237 235
496 Nigeria 20117 C 237 235
497 Nigeria 20118 A 237 235
498 Nigeria 20119 T 237 235
499 Nigeria 20120 T 236 234
500 Nigeria 20121 A 237 236
501 Nigeria 20122 A 237 236
502 Nigeria 20123 T 237 236
503 Nigeria 20124 T 236 235
504 Nigeria 20125 G 236 235
505 Nigeria 20126 G 236 234
506 Nigeria 20127 A 236 234
507 Nigeria 20128 G 236 234
508 Nigeria 20129 A 236 234
509 Nigeria 20130 A 236 234
510 Nigeria 20131 G 236 234
511 Nigeria 20132 C T 236 233 Pro6623Ser
512 Nigeria 20133 C T 236 233 Pro6623Leu
513 Nigeria 20134 G 236 234
514 Nigeria 20135 T 236 234
515 Nigeria 20136 A 236 234
516 Nigeria 20137 A 236 234
517 Nigeria 20138 A 236 234
518 Nigeria 20139 A 236 234
519 Nigeria 20140 A 236 235
520 Nigeria 20141 C 236 235
521 Nigeria 20142 A 236 235
522 Nigeria 20143 C 236 235
523 Nigeria 20144 A 236 235
524 Nigeria 20145 G 236 236
525 Nigeria 20146 T 236 236
526 Nigeria 20147 T 236 236
527 Nigeria 20148 C 236 236
528 Nigeria 20149 A 236 235
529 Nigeria 20150 A 236 235
530 Nigeria 20151 T 236 234
531 Nigeria 20152 T 236 234
532 Nigeria 20153 A 236 234
533 Nigeria 20154 T 236 232
534 Nigeria 20155 T 236 232
535 Nigeria 20156 A 236 231
536 Nigeria 20157 T 236 232
537 Nigeria 20158 A 236 233
538 Nigeria 20159 A 236 233
539 Nigeria 20160 G 236 233
540 Nigeria 20161 A 236 233
541 Nigeria 20162 A 236 233
542 Nigeria 20163 A 236 233
543 Nigeria 20164 G 236 233
544 Nigeria 20165 T 236 233
545 Nigeria 20166 T 235 232
546 Nigeria 20167 G 235 232
547 Nigeria 20168 A 235 232
548 Nigeria 20169 T 235 232
549 Nigeria 20170 G 235 232
550 Nigeria 20171 G 235 233
551 Nigeria 20172 T 235 233
552 Nigeria 20173 G 235 233
553 Nigeria 20174 T 235 233
554 Nigeria 20175 T 235 233
555 Nigeria 20176 G 235 232
556 Nigeria 20177 T 235 232
557 Nigeria 20178 C 235 232
558 Nigeria 20179 C 235 232
559 Nigeria 20180 A 235 232
560 Nigeria 20181 A 235 232
561 Nigeria 20182 C 235 232
562 Nigeria 20183 A 235 232
563 Nigeria 20184 A 235 232
564 Nigeria 20185 T 234 231
565 Nigeria 20186 T 234 230
566 Nigeria 20187 A 233 229
567 Nigeria 20188 C 233 229
568 Nigeria 20189 C 233 229
569 Nigeria 20190 T 233 230
570 Nigeria 20191 G 233 230
571 Nigeria 20192 A 233 230
572 Nigeria 20193 A 233 232
573 Nigeria 20194 A 233 232
574 Nigeria 20195 C 233 232
575 Nigeria 20196 T 229 221
576 Nigeria 20197 T 229 221
577 Nigeria 20198 A T 229 219 Thr6645Ser
578 Nigeria 20199 C 229 221
579 Nigeria 20200 T 229 226
580 Nigeria 20201 T 229 226
581 Nigeria 20202 T 229 225
582 Nigeria 20203 A 228 224
583 Nigeria 20204 C 228 224
584 Nigeria 20205 T 226 222
585 Nigeria 20206 C 226 222
586 Nigeria 20207 A 225 219
587 Nigeria 20208 G 226 222
588 Nigeria 20209 A 226 222
589 Nigeria 20210 G 226 222
590 Nigeria 20211 T 226 222
591 Nigeria 20212 A 226 221
592 Nigeria 20213 G 226 221
593 Nigeria 20214 A 226 221
594 Nigeria 20215 A 226 222
595 Nigeria 20216 A 226 222
596 Nigeria 20217 T 225 218
597 Nigeria 20218 T 225 218
598 Nigeria 20219 T 225 218
599 Nigeria 20220 A 225 218
600 Nigeria 20221 C 225 218
601 Nigeria 20222 A 224 217
602 Nigeria 20223 A 224 217
603 Nigeria 20224 G 224 218
604 Nigeria 20225 A 224 219
605 Nigeria 20226 A 224 220
606 Nigeria 20227 T 224 221
607 Nigeria 20228 T 224 221
608 Nigeria 20229 T 224 221
609 Nigeria 20230 A 224 221
610 Nigeria 20231 A 224 221
611 Nigeria 20232 A 224 220
612 Nigeria 20233 C 224 220
613 Nigeria 20234 C 224 220
614 Nigeria 20235 C 224 221
615 Nigeria 20236 A 224 221
616 Nigeria 20237 G T 224 220 Gly6658*
617 Nigeria 20238 G 224 220
618 Nigeria 20239 A 224 221
619 Nigeria 20240 G 224 221
620 Nigeria 20241 T 224 221
621 Nigeria 20242 C 224 220
622 Nigeria 20243 A 224 220
623 Nigeria 20244 A 224 220
624 Nigeria 20245 A 224 220
625 Nigeria 20246 T 224 218
626 Nigeria 20247 G 224 218
627 Nigeria 20248 G 224 218
628 Nigeria 20249 A 224 218
629 Nigeria 20250 A 224 218
630 Nigeria 20251 A 224 218
631 Nigeria 20252 T 224 218
632 Nigeria 20253 T 224 218
633 Nigeria 20254 G 224 219
634 Nigeria 20255 A 224 219
635 Nigeria 20256 T 224 219
636 Nigeria 20257 T 224 219
637 Nigeria 20258 T 224 220
638 Nigeria 20259 C 224 221
639 Nigeria 20260 T 224 222
640 Nigeria 20261 T 224 222
641 Nigeria 20262 A 224 222
642 Nigeria 20263 G 224 221
643 Nigeria 20264 A 224 222
644 Nigeria 20265 A 224 222
645 Nigeria 20266 T 224 222
646 Nigeria 20267 T 224 222
647 Nigeria 20268 A G 224 220 Ter6668Trpext*?
648 Nigeria 20269 G 224 221
649 Nigeria 20270 C 224 222
650 Nigeria 20271 T 224 222
651 Nigeria 20272 A 223 219
652 Nigeria 20273 T 223 220
653 Nigeria 20274 G 223 221
654 Nigeria 20275 G 223 222
655 Nigeria 20276 A 223 222
656 Nigeria 20277 T 223 222
657 Nigeria 20278 G 223 220
658 Nigeria 20279 A 223 220
659 Nigeria 20280 A 223 220
660 Nigeria 20281 T 225 222
661 Nigeria 20282 T 225 222
662 Nigeria 20283 C 225 221
663 Nigeria 20284 A 225 221
664 Nigeria 20285 T 225 221
665 Nigeria 20286 T 225 221
666 Nigeria 20287 G 225 221
667 Nigeria 20288 A 225 221
668 Nigeria 20289 A 225 221
669 Nigeria 20290 C 225 221
670 Nigeria 20291 G 225 221
671 Nigeria 20292 G 225 224
672 Nigeria 20293 T 225 224
673 Nigeria 20294 A 225 224
674 Nigeria 20295 T 225 224
675 Nigeria 20296 A 225 224
676 Nigeria 20297 A 225 224
677 Nigeria 20298 A 225 224
678 Nigeria 20299 T 225 225
679 Nigeria 20300 T 225 225
680 Nigeria 20301 A 224 221
681 Nigeria 20302 G 224 221
682 Nigeria 20303 A 224 221
683 Nigeria 20304 A 224 221
684 Nigeria 20305 G 224 221
685 Nigeria 20306 G 224 221
686 Nigeria 20307 C 224 221
687 Nigeria 20308 T 224 220
688 Nigeria 20309 A 224 219
689 Nigeria 20310 T 224 219
690 Nigeria 20311 G 225 220
691 Nigeria 20312 C 225 220
692 Nigeria 20313 C 225 220
693 Nigeria 20314 T 225 220
694 Nigeria 20315 T 225 220
695 Nigeria 20316 C 225 220
696 Nigeria 20317 G 225 220
697 Nigeria 20318 A 225 220
698 Nigeria 20319 A 225 220
699 Nigeria 20320 C 225 221
700 Nigeria 20321 A 225 221
701 Nigeria 20322 T 225 221
702 Nigeria 20323 A 225 222
703 Nigeria 20324 T 225 222
704 Nigeria 20325 C 225 223
705 Nigeria 20326 G 225 221
706 Nigeria 20327 T 225 221
707 Nigeria 20328 T 225 221
708 Nigeria 20329 T 225 221
709 Nigeria 20330 A 225 221
710 Nigeria 20331 T 225 221
711 Nigeria 20332 G 225 221
712 Nigeria 20333 G 225 221
713 Nigeria 20334 A 225 221
714 Nigeria 20335 G 225 221
715 Nigeria 20336 A 225 224
716 Nigeria 20337 T 225 224
717 Nigeria 20338 T 225 224
718 Nigeria 20339 T 225 224
719 Nigeria 20340 T 225 224
720 Nigeria 20341 A 225 224
721 Nigeria 20342 G 225 224
722 Nigeria 20343 T 225 224
723 Nigeria 20344 C 225 223
724 Nigeria 20345 A 225 222
725 Nigeria 20346 T 225 223
726 Nigeria 20347 A 225 223
727 Nigeria 20348 G A 225 222 Val6695Ile
728 Nigeria 20349 T 225 223
729 Nigeria 20350 C 225 223
730 Nigeria 20351 A 225 223
731 Nigeria 20352 G 225 223
732 Nigeria 20353 T 225 223
733 Nigeria 20354 T 225 223
734 Nigeria 20355 A 225 223
735 Nigeria 20356 G 225 222
736 Nigeria 20357 G 225 222
737 Nigeria 20358 T 225 222
738 Nigeria 20359 G 225 224
739 Nigeria 20360 G 225 223
740 Nigeria 20361 T 224 222
741 Nigeria 20362 T 224 221
742 Nigeria 20363 T 224 221
743 Nigeria 20364 A 224 220
744 Nigeria 20365 C 224 221
745 Nigeria 20366 A 224 221
746 Nigeria 20367 T 224 221
747 Nigeria 20368 C 224 221
748 Nigeria 20369 T 224 221
749 Nigeria 20370 A 224 221
750 Nigeria 20371 C T 224 220 Tyr6702Tyr
751 Nigeria 20372 T 224 220
752 Nigeria 20373 G T 224 220 Ter6703Leuext*?
753 Nigeria 20374 A G 224 190 Ter6703Trpext*?
754 Nigeria 20375 T 224 220
755 Nigeria 20376 T C 224 215 Leu6704Ser
756 Nigeria 20377 G 224 220
757 Nigeria 20378 G 225 224
758 Nigeria 20379 A 225 224
759 Nigeria 20380 C 225 224
760 Nigeria 20381 T 225 224
761 Nigeria 20382 A 225 224
762 Nigeria 20383 G 225 224
763 Nigeria 20384 C 225 224
764 Nigeria 20385 T 225 224
765 Nigeria 20386 A 225 224
766 Nigeria 20387 A 225 223
767 Nigeria 20388 A 225 223
768 Nigeria 20389 C 225 223
769 Nigeria 20390 G 225 223
770 Nigeria 20391 T 225 223
771 Nigeria 20392 T 225 223
772 Nigeria 20393 T 225 222
773 Nigeria 20394 T 225 222
774 Nigeria 20395 A 225 222
775 Nigeria 20396 A 226 223
776 Nigeria 20397 G 226 223
777 Nigeria 20398 G 226 223
778 Nigeria 20399 A 226 224
779 Nigeria 20400 A 226 223
780 Nigeria 20401 T 226 223
781 Nigeria 20402 C T 226 221 His6713Tyr
782 Nigeria 20403 A 226 223
783 Nigeria 20404 C 226 223
784 Nigeria 20405 C 226 223
785 Nigeria 20406 T 226 223
786 Nigeria 20407 T 226 223
787 Nigeria 20408 T 226 223
788 Nigeria 20409 T 226 223
789 Nigeria 20410 G 226 223
790 Nigeria 20411 A C 226 222 Asn6716His
791 Nigeria 20412 A 226 223
792 Nigeria 20413 T 226 222
793 Nigeria 20414 T 226 222
794 Nigeria 20415 A 226 222
795 Nigeria 20416 G 226 222
796 Nigeria 20417 A 226 222
797 Nigeria 20418 A 226 222
798 Nigeria 20419 G 226 222
799 Nigeria 20420 A 226 222
800 Nigeria 20421 T 226 222
801 Nigeria 20422 T 226 223
802 Nigeria 20423 T 226 223
803 Nigeria 20424 T 226 223
804 Nigeria 20425 A 226 224
805 Nigeria 20426 T 226 224
806 Nigeria 20427 T 226 224
807 Nigeria 20428 C 226 224
808 Nigeria 20429 C 226 224
809 Nigeria 20430 T 226 224
810 Nigeria 20431 A 226 224
811 Nigeria 20432 T 226 224
812 Nigeria 20433 G T 226 223 Trp6723Leu
813 Nigeria 20434 G 226 224
814 Nigeria 20435 A 226 224
815 Nigeria 20436 C T 226 221 Thr6724Ile
816 Nigeria 20437 A 226 223
817 Nigeria 20438 G 226 223
818 Nigeria 20439 T 226 224
819 Nigeria 20440 A 226 224
820 Nigeria 20441 C 226 224
821 Nigeria 20442 A 225 223
822 Nigeria 20443 G 225 224
823 Nigeria 20444 T 225 224
824 Nigeria 20445 T 225 224
825 Nigeria 20446 A 225 224
826 Nigeria 20447 A 225 224
827 Nigeria 20448 A 225 224
828 Nigeria 20449 A 225 224
829 Nigeria 20450 A 225 224
830 Nigeria 20451 C 225 224
831 Nigeria 20452 T 225 224
832 Nigeria 20453 A 225 224
833 Nigeria 20454 T 225 224
834 Nigeria 20455 T 225 224
835 Nigeria 20456 T 225 224
836 Nigeria 20457 C 225 224
837 Nigeria 20458 A 225 224
838 Nigeria 20459 T 225 224
839 Nigeria 20460 A 225 224
840 Nigeria 20461 A 225 224
841 Nigeria 20462 C 225 224
842 Nigeria 20463 A 225 224
843 Nigeria 20464 G 225 224
844 Nigeria 20465 A 225 224
845 Nigeria 20466 T 225 224
846 Nigeria 20467 G 225 224
847 Nigeria 20468 C 225 224
848 Nigeria 20469 G 225 224
849 Nigeria 20470 C 225 224
850 Nigeria 20471 A 225 224
851 Nigeria 20472 A 225 224
852 Nigeria 20473 A 225 223
853 Nigeria 20474 C 225 223
854 Nigeria 20475 A 225 223
855 Nigeria 20476 G 225 223
856 Nigeria 20477 G 225 223
857 Nigeria 20478 T 225 223
858 Nigeria 20479 T 225 223
859 Nigeria 20480 C 225 223
860 Nigeria 20481 A 225 223
861 Nigeria 20482 T 225 223
862 Nigeria 20483 C 225 224
863 Nigeria 20484 T 225 224
864 Nigeria 20485 A 225 224
865 Nigeria 20486 A 225 224
866 Nigeria 20487 G 225 224
867 Nigeria 20488 T 225 224
868 Nigeria 20489 G 225 224
869 Nigeria 20490 T 225 224
870 Nigeria 20491 G 225 224
871 Nigeria 20492 T 225 224
872 Nigeria 20493 G 225 224
873 Nigeria 20494 T 225 224
874 Nigeria 20495 G 225 225
875 Nigeria 20496 T 225 225
876 Nigeria 20497 T 226 226
877 Nigeria 20498 C 226 226
878 Nigeria 20499 T 225 224
879 Nigeria 20500 G 225 224
880 Nigeria 20501 T 225 224
881 Nigeria 20502 T 225 224
882 Nigeria 20503 A 225 224
883 Nigeria 20504 T 225 224
884 Nigeria 20505 T 225 224
885 Nigeria 20506 G 225 224
886 Nigeria 20507 A 225 224
887 Nigeria 20508 T 225 225
888 Nigeria 20509 T 225 225
889 Nigeria 20510 T 225 225
890 Nigeria 20511 A 225 225
891 Nigeria 20512 T 225 225
892 Nigeria 20513 T 225 224
893 Nigeria 20514 A 225 224
894 Nigeria 20515 C 225 224
895 Nigeria 20516 T 225 223
896 Nigeria 20517 T 225 223
897 Nigeria 20518 G 225 224
898 Nigeria 20519 A 225 224
899 Nigeria 20520 T 225 224
900 Nigeria 20521 G 225 224
901 Nigeria 20522 A 225 224
902 Nigeria 20523 T 225 224
903 Nigeria 20524 T 225 224
904 Nigeria 20525 T 225 223
905 Nigeria 20526 T 225 223
906 Nigeria 20527 G 225 223
907 Nigeria 20528 T 225 223
908 Nigeria 20529 T 225 221
909 Nigeria 20530 G 225 221
910 Nigeria 20531 A 225 221
911 Nigeria 20532 A 225 221
912 Nigeria 20533 A 225 221
913 Nigeria 20534 T 225 221
914 Nigeria 20535 A 225 221
915 Nigeria 20536 A 225 221
916 Nigeria 20537 T 225 221
917 Nigeria 20538 A 225 221
918 Nigeria 20539 A 225 221
919 Nigeria 20540 A 225 221
920 Nigeria 20541 A 225 221
921 Nigeria 20542 T 225 222
922 Nigeria 20543 C 225 222
923 Nigeria 20544 C 225 222
924 Nigeria 20545 C 225 222
925 Nigeria 20546 A 225 222
926 Nigeria 20547 A 225 222
927 Nigeria 20548 G 225 223
928 Nigeria 20549 A 225 223
929 Nigeria 20550 T 225 223
930 Nigeria 20551 T 225 223
931 Nigeria 20552 T 225 222
932 Nigeria 20553 A 225 222
933 Nigeria 20554 T 225 222
934 Nigeria 20555 C 225 222
935 Nigeria 20556 T 225 222
936 Nigeria 20557 G 225 222
937 Nigeria 20558 T 225 222
938 Nigeria 20559 A 225 222
939 Nigeria 20560 G 225 222
940 Nigeria 20561 T 225 223
941 Nigeria 20562 T 225 223
942 Nigeria 20563 T 225 223
943 Nigeria 20564 C 225 223
944 Nigeria 20565 T 225 223
945 Nigeria 20566 A 225 223
946 Nigeria 20567 A 225 225
947 Nigeria 20568 G 225 225
948 Nigeria 20569 G 225 225
949 Nigeria 20570 T 225 225
950 Nigeria 20571 T 225 225
951 Nigeria 20572 G 225 225
952 Nigeria 20573 T 225 225
953 Nigeria 20574 C 225 225
954 Nigeria 20575 A 225 225
955 Nigeria 20576 A 225 225
956 Nigeria 20577 A 225 225
957 Nigeria 20578 G 225 225
958 Nigeria 20579 T 225 225
959 Nigeria 20580 G T 225 224 Ter6772Leuext*?
960 Nigeria 20581 A 225 224
961 Nigeria 20582 C 225 223
962 Nigeria 20583 T 225 223
963 Nigeria 20584 A 225 223
964 Nigeria 20585 T 225 223
965 Nigeria 20586 T 225 223
966 Nigeria 20587 G 225 223
967 Nigeria 20588 A 225 223
968 Nigeria 20589 C 225 223
969 Nigeria 20590 T 225 222
970 Nigeria 20591 A 225 222
971 Nigeria 20592 T 225 222
972 Nigeria 20593 A 225 222
973 Nigeria 20594 C 225 222
974 Nigeria 20595 A 225 222
975 Nigeria 20596 G 225 222
976 Nigeria 20597 A 225 222
977 Nigeria 20598 A 225 223
978 Nigeria 20599 A 225 224
979 Nigeria 20600 T 225 224
980 Nigeria 20601 T 224 223
981 Nigeria 20602 T 224 223
982 Nigeria 20603 C 224 224
983 Nigeria 20604 A 224 224
984 Nigeria 20605 T 224 224
985 Nigeria 20606 T 224 224
986 Nigeria 20607 T 224 224
987 Nigeria 20608 A 224 224
988 Nigeria 20609 T 224 224
989 Nigeria 20610 G 224 224
990 Nigeria 20611 C 224 223
991 Nigeria 20612 T 224 223
992 Nigeria 20613 T 224 223
993 Nigeria 20614 T 224 223
994 Nigeria 20615 G 224 223
995 Nigeria 20616 G 224 223
996 Nigeria 20617 T 223 222
997 Nigeria 20618 G 223 222
998 Nigeria 20619 T 223 222
999 Nigeria 20620 A 223 222
1000 Nigeria 20621 A 223 222
1001 Nigeria 20622 A 223 222
1002 Nigeria 20623 G 223 222
1003 Nigeria 20624 A 223 222
1004 Nigeria 20625 T 223 223
1005 Nigeria 20626 G 223 223
1006 Nigeria 20627 G 223 223
1007 Nigeria 20628 C 223 223
1008 Nigeria 20629 C 223 223
1009 Nigeria 20630 A 223 223
1010 Nigeria 20631 T 223 223
1011 Nigeria 20632 G 223 223
1012 Nigeria 20633 T 222 222
1013 Nigeria 20634 A 222 222
1014 Nigeria 20635 G 222 222
1015 Nigeria 20636 A 221 221
1016 Nigeria 20637 A 221 220
1017 Nigeria 20638 A 221 220
1018 Nigeria 20639 C 221 220
1019 Nigeria 20640 A 221 220
1020 Nigeria 20641 T 221 221
1021 Nigeria 20642 T 221 221
1022 Nigeria 20643 T 221 221
1023 Nigeria 20644 T 221 221
1024 Nigeria 20645 A 221 221
1025 Nigeria 20646 C 221 221
1026 Nigeria 20647 C 221 221
1027 Nigeria 20648 C 221 221
1028 Nigeria 20649 A 221 221
1029 Nigeria 20650 A 221 221
1030 Nigeria 20651 A 221 221
1031 Nigeria 20652 A 221 221
1032 Nigeria 20653 T 221 221
1033 Nigeria 20654 T 221 221
1034 Nigeria 20655 A 221 221
1035 Nigeria 20656 C 221 221
1036 Nigeria 20657 A 221 221
1037 Nigeria 20658 A 221 221