National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     75                                        
-     1,038                                        
?                                              
A     9                                        
C     9                                        
D     9                                        
E     21                                        
F     39                                        
G     15                                        
H     36                                        
I     69                                        
K     87                                        
L     207                                        
M     60                                        
N     62                                        
P     21                                        
Q     39                                        
R     31                                        
S     57                                        
T     42                                        
V     87                                        
W     18                                        
Y     45                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 19621 A 5 5
1 Brunei 19622 G 5 5
2 Brunei 19623 T 5 5
3 Brunei 19624 T 5 5
4 Brunei 19625 T 5 5
5 Brunei 19626 A 5 5
6 Brunei 19627 G 5 5
7 Brunei 19628 A 5 5
8 Brunei 19629 A 5 5
9 Brunei 19630 A 5 5
10 Brunei 19631 A 5 5
11 Brunei 19632 T 5 5
12 Brunei 19633 G 5 5
13 Brunei 19634 T 5 5
14 Brunei 19635 G 5 5
15 Brunei 19636 G 5 5
16 Brunei 19637 C 5 5
17 Brunei 19638 T 5 5
18 Brunei 19639 T 5 5
19 Brunei 19640 T 5 5
20 Brunei 19641 T 5 5
21 Brunei 19642 A 5 5
22 Brunei 19643 A 5 5
23 Brunei 19644 T 5 5
24 Brunei 19645 G 5 5
25 Brunei 19646 T 5 5
26 Brunei 19647 T 5 5
27 Brunei 19648 G 5 5
28 Brunei 19649 T 5 5
29 Brunei 19650 A 5 5
30 Brunei 19651 A 5 5
31 Brunei 19652 A 5 5
32 Brunei 19653 T 5 5
33 Brunei 19654 A 5 5
34 Brunei 19655 A 5 5
35 Brunei 19656 G 5 5
36 Brunei 19657 G 5 5
37 Brunei 19658 G 5 5
38 Brunei 19659 A 5 5
39 Brunei 19660 C 5 5
40 Brunei 19661 A 5 5
41 Brunei 19662 C 5 5
42 Brunei 19663 T 5 5
43 Brunei 19664 T 5 5
44 Brunei 19665 T 5 5
45 Brunei 19666 G 5 5
46 Brunei 19667 A 5 5
47 Brunei 19668 T 5 5
48 Brunei 19669 G 5 5
49 Brunei 19670 G 5 5
50 Brunei 19671 A 5 5
51 Brunei 19672 C 5 5
52 Brunei 19673 A 5 5
53 Brunei 19674 A 5 5
54 Brunei 19675 C 5 5
55 Brunei 19676 A 5 5
56 Brunei 19677 G 5 5
57 Brunei 19678 G 5 5
58 Brunei 19679 G 5 5
59 Brunei 19680 T 5 5
60 Brunei 19681 G 5 5
61 Brunei 19682 A 5 5
62 Brunei 19683 A 5 5
63 Brunei 19684 G 5 5
64 Brunei 19685 T 5 5
65 Brunei 19686 A 5 5
66 Brunei 19687 C 5 5
67 Brunei 19688 C 5 5
68 Brunei 19689 A 5 5
69 Brunei 19690 G 5 5
70 Brunei 19691 T 5 5
71 Brunei 19692 T 5 5
72 Brunei 19693 T 5 5
73 Brunei 19694 C 5 5
74 Brunei 19695 T 5 5
75 Brunei 19696 A 5 5
76 Brunei 19697 T 5 5
77 Brunei 19698 C 5 5
78 Brunei 19699 A 5 5
79 Brunei 19700 T 5 5
80 Brunei 19701 T 5 5
81 Brunei 19702 A 5 5
82 Brunei 19703 A 5 5
83 Brunei 19704 T 5 5
84 Brunei 19705 A 5 5
85 Brunei 19706 A 5 5
86 Brunei 19707 C 5 5
87 Brunei 19708 A 5 5
88 Brunei 19709 C 5 5
89 Brunei 19710 T 5 5
90 Brunei 19711 G 5 5
91 Brunei 19712 T 5 5
92 Brunei 19713 T 5 5
93 Brunei 19714 T 5 5
94 Brunei 19715 A 5 5
95 Brunei 19716 C 5 5
96 Brunei 19717 A 5 5
97 Brunei 19718 C 5 5
98 Brunei 19719 A 5 5
99 Brunei 19720 A 5 5
100 Brunei 19721 A 5 5
101 Brunei 19722 A 5 5
102 Brunei 19723 G 5 5
103 Brunei 19724 T 5 5
104 Brunei 19725 T 5 5
105 Brunei 19726 G 5 5
106 Brunei 19727 A 5 5
107 Brunei 19728 T 5 5
108 Brunei 19729 G 5 5
109 Brunei 19730 G 5 5
110 Brunei 19731 T 5 5
111 Brunei 19732 G 5 5
112 Brunei 19733 T 5 5
113 Brunei 19734 T 5 5
114 Brunei 19735 G 5 5
115 Brunei 19736 A 5 5
116 Brunei 19737 T 5 5
117 Brunei 19738 G 5 5
118 Brunei 19739 T 5 5
119 Brunei 19740 A 5 5
120 Brunei 19741 G 5 5
121 Brunei 19742 A 5 5
122 Brunei 19743 A 5 5
123 Brunei 19744 T 5 5
124 Brunei 19745 T 5 5
125 Brunei 19746 G 5 5
126 Brunei 19747 T 5 5
127 Brunei 19748 T 5 5
128 Brunei 19749 T 5 5
129 Brunei 19750 G 5 5
130 Brunei 19751 A 5 5
131 Brunei 19752 A 5 5
132 Brunei 19753 A 5 5
133 Brunei 19754 A 5 5
134 Brunei 19755 T 5 5
135 Brunei 19756 A 5 5
136 Brunei 19757 A 5 5
137 Brunei 19758 A 5 5
138 Brunei 19759 A 5 5
139 Brunei 19760 C 5 5
140 Brunei 19761 A 5 5
141 Brunei 19762 A 5 5
142 Brunei 19763 C 5 5
143 Brunei 19764 A 5 5
144 Brunei 19765 T 5 5
145 Brunei 19766 T 5 5
146 Brunei 19767 A 5 5
147 Brunei 19768 C 5 5
148 Brunei 19769 C 5 5
149 Brunei 19770 T 5 5
150 Brunei 19771 G 5 5
151 Brunei 19772 T 5 5
152 Brunei 19773 T 5 5
153 Brunei 19774 A 5 5
154 Brunei 19775 A 5 5
155 Brunei 19776 T 5 5
156 Brunei 19777 G 5 5
157 Brunei 19778 T 5 5
158 Brunei 19779 A 5 5
159 Brunei 19780 G 5 5
160 Brunei 19781 C 5 5
161 Brunei 19782 A 5 5
162 Brunei 19783 T 5 5
163 Brunei 19784 T 5 5
164 Brunei 19785 T 5 5
165 Brunei 19786 G 5 5
166 Brunei 19787 A 5 5
167 Brunei 19788 G 5 5
168 Brunei 19789 C 5 5
169 Brunei 19790 T 5 5
170 Brunei 19791 T 5 5
171 Brunei 19792 T 5 5
172 Brunei 19793 G 5 5
173 Brunei 19794 G 5 5
174 Brunei 19795 G 5 5
175 Brunei 19796 C 5 5
176 Brunei 19797 T 5 5
177 Brunei 19798 A 5 5
178 Brunei 19799 A 5 5
179 Brunei 19800 G 5 5
180 Brunei 19801 C 5 5
181 Brunei 19802 G 5 5
182 Brunei 19803 C 5 5
183 Brunei 19804 A 5 5
184 Brunei 19805 A 5 5
185 Brunei 19806 C 5 5
186 Brunei 19807 A 5 5
187 Brunei 19808 T 5 5
188 Brunei 19809 T 5 5
189 Brunei 19810 A 5 5
190 Brunei 19811 A 5 5
191 Brunei 19812 A 5 5
192 Brunei 19813 C 5 5
193 Brunei 19814 C 5 5
194 Brunei 19815 A 5 5
195 Brunei 19816 G 5 5
196 Brunei 19817 T 5 5
197 Brunei 19818 A 5 5
198 Brunei 19819 C 5 5
199 Brunei 19820 C 5 5
200 Brunei 19821 A 5 5
201 Brunei 19822 G 5 5
202 Brunei 19823 A 5 5
203 Brunei 19824 G 5 5
204 Brunei 19825 G 5 5
205 Brunei 19826 T 5 5
206 Brunei 19827 G 5 5
207 Brunei 19828 A 5 5
208 Brunei 19829 A 5 5
209 Brunei 19830 A 5 5
210 Brunei 19831 A 5 5
211 Brunei 19832 T 5 5
212 Brunei 19833 A 5 5
213 Brunei 19834 C 5 5
214 Brunei 19835 T 5 5
215 Brunei 19836 C 5 5
216 Brunei 19837 A 5 5
217 Brunei 19838 A 5 5
218 Brunei 19839 T 5 5
219 Brunei 19840 A 5 5
220 Brunei 19841 A 5 5
221 Brunei 19842 T 5 5
222 Brunei 19843 T 5 5
223 Brunei 19844 T 5 5
224 Brunei 19845 G 5 5
225 Brunei 19846 G 5 5
226 Brunei 19847 G 5 5
227 Brunei 19848 T 5 5
228 Brunei 19849 G 5 5
229 Brunei 19850 T 5 5
230 Brunei 19851 G 5 5
231 Brunei 19852 G 5 5
232 Brunei 19853 A 5 5
233 Brunei 19854 C 5 5
234 Brunei 19855 A 5 5
235 Brunei 19856 T 5 5
236 Brunei 19857 T 5 5
237 Brunei 19858 G 5 5
238 Brunei 19859 C 5 5
239 Brunei 19860 T 5 5
240 Brunei 19861 G 5 5
241 Brunei 19862 C 5 5
242 Brunei 19863 T 5 5
243 Brunei 19864 A 5 5
244 Brunei 19865 A 5 5
245 Brunei 19866 T 5 5
246 Brunei 19867 A 5 5
247 Brunei 19868 C 5 5
248 Brunei 19869 T 5 5
249 Brunei 19870 G 5 5
250 Brunei 19871 T 5 5
251 Brunei 19872 G 5 5
252 Brunei 19873 A 5 5
253 Brunei 19874 T 5 5
254 Brunei 19875 C 5 5
255 Brunei 19876 T 5 5
256 Brunei 19877 G 5 5
257 Brunei 19878 G 5 5
258 Brunei 19879 G 5 5
259 Brunei 19880 A 5 5
260 Brunei 19881 C 5 5
261 Brunei 19882 T 5 5
262 Brunei 19883 A 5 5
263 Brunei 19884 C 5 5
264 Brunei 19885 A 5 5
265 Brunei 19886 A 5 5
266 Brunei 19887 A 5 5
267 Brunei 19888 A 5 5
268 Brunei 19889 G 5 5
269 Brunei 19890 A 5 5
270 Brunei 19891 G 5 5
271 Brunei 19892 A 5 5
272 Brunei 19893 T 5 5
273 Brunei 19894 G 5 5
274 Brunei 19895 C 5 5
275 Brunei 19896 T 5 5
276 Brunei 19897 C 5 5
277 Brunei 19898 C 5 5
278 Brunei 19899 A 5 5
279 Brunei 19900 G 5 5
280 Brunei 19901 C 5 5
281 Brunei 19902 A 5 5
282 Brunei 19903 C 5 5
283 Brunei 19904 A 5 5
284 Brunei 19905 T 5 5
285 Brunei 19906 A 5 5
286 Brunei 19907 T 5 5
287 Brunei 19908 A 5 5
288 Brunei 19909 T 5 5
289 Brunei 19910 C 5 5
290 Brunei 19911 T 5 5
291 Brunei 19912 A 5 5
292 Brunei 19913 C 5 5
293 Brunei 19914 T 5 5
294 Brunei 19915 A 5 5
295 Brunei 19916 T 5 5
296 Brunei 19917 T 5 5
297 Brunei 19918 G 5 5
298 Brunei 19919 G 5 5
299 Brunei 19920 T 5 5
300 Brunei 19921 G 5 5
301 Brunei 19922 T 5 5
302 Brunei 19923 T 5 5
303 Brunei 19924 T 5 5
304 Brunei 19925 G 5 5
305 Brunei 19926 T 5 5
306 Brunei 19927 T 5 5
307 Brunei 19928 C 5 5
308 Brunei 19929 T 5 5
309 Brunei 19930 A 5 5
310 Brunei 19931 T 5 5
311 Brunei 19932 G 5 5
312 Brunei 19933 A 5 5
313 Brunei 19934 C 5 5
314 Brunei 19935 T 5 5
315 Brunei 19936 G 5 5
316 Brunei 19937 A 5 5
317 Brunei 19938 C 5 5
318 Brunei 19939 A 5 5
319 Brunei 19940 T 5 5
320 Brunei 19941 A 5 5
321 Brunei 19942 G 5 5
322 Brunei 19943 C 5 5
323 Brunei 19944 C 5 5
324 Brunei 19945 A 5 5
325 Brunei 19946 A 5 5
326 Brunei 19947 G 5 5
327 Brunei 19948 A 5 5
328 Brunei 19949 A 5 5
329 Brunei 19950 A 5 5
330 Brunei 19951 C 5 5
331 Brunei 19952 C 5 5
332 Brunei 19953 A 5 5
333 Brunei 19954 A 5 5
334 Brunei 19955 C 5 5
335 Brunei 19956 T 5 5
336 Brunei 19957 G 5 5
337 Brunei 19958 A 5 5
338 Brunei 19959 A 5 5
339 Brunei 19960 A 5 5
340 Brunei 19961 C 5 5
341 Brunei 19962 G 5 5
342 Brunei 19963 A 5 5
343 Brunei 19964 T 5 5
344 Brunei 19965 T 5 5
345 Brunei 19966 T 5 5
346 Brunei 19967 G 5 5
347 Brunei 19968 T 5 5
348 Brunei 19969 G 5 5
349 Brunei 19970 C 5 5
350 Brunei 19971 A 5 5
351 Brunei 19972 C 5 5
352 Brunei 19973 C 5 5
353 Brunei 19974 A 5 5
354 Brunei 19975 C 5 5
355 Brunei 19976 T 5 5
356 Brunei 19977 C 5 5
357 Brunei 19978 A 5 5
358 Brunei 19979 C 5 5
359 Brunei 19980 T 5 5
360 Brunei 19981 G 5 5
361 Brunei 19982 T 5 5
362 Brunei 19983 C 5 5
363 Brunei 19984 T 5 5
364 Brunei 19985 T 5 5
365 Brunei 19986 T 5 5
366 Brunei 19987 T 5 5
367 Brunei 19988 T 5 5
368 Brunei 19989 T 5 5
369 Brunei 19990 G 5 5
370 Brunei 19991 A 5 5
371 Brunei 19992 T 5 5
372 Brunei 19993 G 5 5
373 Brunei 19994 G 5 5
374 Brunei 19995 T 5 5
375 Brunei 19996 A 5 5
376 Brunei 19997 G 5 5
377 Brunei 19998 A 5 5
378 Brunei 19999 G 5 5
379 Brunei 20000 T 5 5
380 Brunei 20001 T 5 5
381 Brunei 20002 G 5 5
382 Brunei 20003 A 5 5
383 Brunei 20004 T 5 5
384 Brunei 20005 G 5 5
385 Brunei 20006 G 5 5
386 Brunei 20007 T 5 5
387 Brunei 20008 C 5 5
388 Brunei 20009 A 5 5
389 Brunei 20010 A 5 5
390 Brunei 20011 G 5 5
391 Brunei 20012 T 5 5
392 Brunei 20013 A 5 5
393 Brunei 20014 G 5 5
394 Brunei 20015 A 5 5
395 Brunei 20016 C 5 5
396 Brunei 20017 T 5 5
397 Brunei 20018 T 5 5
398 Brunei 20019 A 5 5
399 Brunei 20020 T 5 5
400 Brunei 20021 T 5 5
401 Brunei 20022 T 5 5
402 Brunei 20023 A 5 5
403 Brunei 20024 G 5 5
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