National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     39                                        
-     458                                        
?                                              
A     6                                        
C     6                                        
D     3                                        
E     6                                        
F     18                                        
G     9                                        
H     12                                        
I     39                                        
K     39                                        
L     84                                        
M     21                                        
N     38                                        
P     9                                        
Q     15                                        
R     12                                        
S     24                                        
T     12                                        
V     36                                        
W     9                                        
Y     21                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 20201 T 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 20202 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 20203 A 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 20204 C 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 20205 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 20206 C 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 20207 A 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 20208 G 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 20209 A 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 20210 G 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 20211 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 20212 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 20213 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 20214 A 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 20215 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 20216 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 20217 T 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 20218 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 20219 T 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 20220 A 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 20221 C 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 20222 A 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 20223 A 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 20224 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 20225 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 20226 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 20227 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 20228 T 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 20229 T 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 20230 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 20231 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 20232 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 20233 C 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 20234 C 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 20235 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 20236 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 20237 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 20238 G 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 20239 A 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 20240 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 20241 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 20242 C 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 20243 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 20244 A 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 20245 A 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 20246 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 20247 G 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 20248 G 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 20249 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 20250 A 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 20251 A 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 20252 T 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 20253 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 20254 G 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 20255 A 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 20256 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 20257 T 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 20258 T 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 20259 C 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 20260 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 20261 T 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 20262 A 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 20263 G 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 20264 A 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 20265 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 20266 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 20267 T 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 20268 A 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 20269 G 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 20270 C 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 20271 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 20272 A 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 20273 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 20274 G 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 20275 G 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 20276 A 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 20277 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 20278 G 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 20279 A 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 20280 A 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 20281 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 20282 T 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 20283 C 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 20284 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 20285 T 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 20286 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 20287 G 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 20288 A 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 20289 A 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 20290 C 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 20291 G 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 20292 G 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 20293 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 20294 A 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 20295 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 20296 A 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 20297 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 20298 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 20299 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 20300 T 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 20301 A 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 20302 G 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 20303 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 20304 A 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 20305 G 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 20306 G 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 20307 C 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 20308 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 20309 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 20310 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 20311 G 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 20312 C 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 20313 C 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 20314 T 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 20315 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 20316 C 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 20317 G 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 20318 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 20319 A 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 20320 C 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 20321 A 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 20322 T 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 20323 A 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 20324 T 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 20325 C 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 20326 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 20327 T 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 20328 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 20329 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 20330 A 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 20331 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 20332 G 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 20333 G 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 20334 A 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 20335 G 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 20336 A 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 20337 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 20338 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 20339 T 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 20340 T 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 20341 A 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 20342 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 20343 T 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 20344 C 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 20345 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 20346 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 20347 A 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 20348 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 20349 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 20350 C 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 20351 A 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 20352 G 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 20353 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 20354 T 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 20355 A 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 20356 G 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 20357 G 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 20358 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 20359 G 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 20360 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 20361 T 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 20362 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 20363 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 20364 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 20365 C 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 20366 A 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 20367 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 20368 C 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 20369 T 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 20370 A 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 20371 C 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 20372 T 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 20373 G 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 20374 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 20375 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 20376 T 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 20377 G 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 20378 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 20379 A 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 20380 C 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 20381 T 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 20382 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 20383 G 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 20384 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 20385 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 20386 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 20387 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 20388 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 20389 C 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 20390 G 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 20391 T 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 20392 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 20393 T 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 20394 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 20395 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 20396 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 20397 G 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 20398 G 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 20399 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 20400 A 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 20401 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 20402 C 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 20403 A 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 20404 C 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 20405 C 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 20406 T 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 20407 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 20408 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 20409 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 20410 G 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 20411 A 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 20412 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 20413 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 20414 T 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 20415 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 20416 G 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 20417 A 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 20418 A 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 20419 G 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 20420 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 20421 T 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 20422 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 20423 T 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 20424 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 20425 A 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 20426 T 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 20427 T 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 20428 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 20429 C 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 20430 T 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 20431 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 20432 T 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 20433 G 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 20434 G 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 20435 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 20436 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 20437 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 20438 G 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 20439 T 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 20440 A 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 20441 C 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 20442 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 20443 G 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 20444 T 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 20445 T 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 20446 A 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 20447 A 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 20448 A 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 20449 A 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 20450 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 20451 C 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 20452 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 20453 A 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 20454 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 20455 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 20456 T 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 20457 C 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 20458 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 20459 T 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 20460 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 20461 A 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 20462 C 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 20463 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 20464 G 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 20465 A 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 20466 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 20467 G 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 20468 C 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 20469 G 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 20470 C 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 20471 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 20472 A 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 20473 A 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 20474 C 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 20475 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 20476 G 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 20477 G 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 20478 T 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 20479 T 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 20480 C 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 20481 A 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 20482 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 20483 C 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 20484 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 20485 A 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 20486 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 20487 G 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 20488 T 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 20489 G 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 20490 T 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 20491 G 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 20492 T 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 20493 G 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 20494 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 20495 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 20496 T 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 20497 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 20498 C 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 20499 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 20500 G 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 20501 T 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 20502 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 20503 A 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 20504 T 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 20505 T 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 20506 G 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 20507 A 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 20508 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 20509 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 20510 T 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 20511 A 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 20512 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 20513 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 20514 A 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 20515 C 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 20516 T 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 20517 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 20518 G 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 20519 A 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 20520 T 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 20521 G 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 20522 A 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 20523 T 1 1
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