National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     174                                        
-     2,739                                        
?                                              
A     66                                        
C     81                                        
D     36                                        
E     54                                        
F     78                                        
G     48                                        
H     81                                        
I     237                                        
K     111                                        
L     487                   1                    
M     183                                        
N     105                                        
P     54                                        
Q     117                                        
R     80                                        
S     195                                        
T     222                                        
V     213                                        
W     21                                        
Y     96                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 13498 A 5 5
1 Brunei 13499 C 5 5
2 Brunei 13500 A 5 5
3 Brunei 13501 C 5 5
4 Brunei 13502 C 5 5
5 Brunei 13503 G 5 5
6 Brunei 13504 T 5 5
7 Brunei 13505 G 5 5
8 Brunei 13506 C 5 5
9 Brunei 13507 G 5 5
10 Brunei 13508 G 5 5
11 Brunei 13509 C 5 5
12 Brunei 13510 A 5 5
13 Brunei 13511 C 5 5
14 Brunei 13512 A 5 5
15 Brunei 13513 G 5 5
16 Brunei 13514 G 5 5
17 Brunei 13515 C 5 5
18 Brunei 13516 A 5 5
19 Brunei 13517 C 5 5
20 Brunei 13518 T 5 5
21 Brunei 13519 A 5 5
22 Brunei 13520 G 5 5
23 Brunei 13521 T 5 5
24 Brunei 13522 A 5 5
25 Brunei 13523 C 5 5
26 Brunei 13524 T 5 5
27 Brunei 13525 G 5 5
28 Brunei 13526 A 5 5
29 Brunei 13527 T 5 5
30 Brunei 13528 G 5 5
31 Brunei 13529 T 5 5
32 Brunei 13530 C 5 5
33 Brunei 13531 G 5 5
34 Brunei 13532 T 5 5
35 Brunei 13533 A 5 5
36 Brunei 13534 T 5 5
37 Brunei 13535 A 5 5
38 Brunei 13536 C 5 5
39 Brunei 13537 A 5 5
40 Brunei 13538 G 5 5
41 Brunei 13539 G 5 5
42 Brunei 13540 G 5 5
43 Brunei 13541 C 5 5
44 Brunei 13542 T 5 5
45 Brunei 13543 T 5 5
46 Brunei 13544 T 5 5
47 Brunei 13545 T 5 5
48 Brunei 13546 G 5 5
49 Brunei 13547 A 5 5
50 Brunei 13548 C 5 5
51 Brunei 13549 A 5 5
52 Brunei 13550 T 5 5
53 Brunei 13551 C 5 5
54 Brunei 13552 T 5 5
55 Brunei 13553 A 5 5
56 Brunei 13554 C 5 5
57 Brunei 13555 A 5 5
58 Brunei 13556 A 5 5
59 Brunei 13557 T 5 5
60 Brunei 13558 G 5 5
61 Brunei 13559 A 5 5
62 Brunei 13560 T 5 5
63 Brunei 13561 A 5 5
64 Brunei 13562 A 5 5
65 Brunei 13563 A 5 5
66 Brunei 13564 G 5 5
67 Brunei 13565 T 5 5
68 Brunei 13566 A 5 5
69 Brunei 13567 G 5 5
70 Brunei 13568 C 5 5
71 Brunei 13569 T 5 5
72 Brunei 13570 G 5 5
73 Brunei 13571 G 5 5
74 Brunei 13572 T 5 5
75 Brunei 13573 T 5 5
76 Brunei 13574 T 5 5
77 Brunei 13575 T 5 5
78 Brunei 13576 G 5 5
79 Brunei 13577 C 5 5
80 Brunei 13578 T 5 5
81 Brunei 13579 A 5 5
82 Brunei 13580 A 5 5
83 Brunei 13581 A 5 5
84 Brunei 13582 T 5 5
85 Brunei 13583 T 5 5
86 Brunei 13584 C 5 5
87 Brunei 13585 C 5 5
88 Brunei 13586 T 5 5
89 Brunei 13587 A 5 5
90 Brunei 13588 A 5 5
91 Brunei 13589 A 5 5
92 Brunei 13590 A 5 5
93 Brunei 13591 A 5 5
94 Brunei 13592 C 5 5
95 Brunei 13593 T 5 5
96 Brunei 13594 A 5 5
97 Brunei 13595 A 5 5
98 Brunei 13596 T 5 5
99 Brunei 13597 T 5 5
100 Brunei 13598 G 5 5
101 Brunei 13599 T 5 5
102 Brunei 13600 T 5 5
103 Brunei 13601 G 5 5
104 Brunei 13602 T 5 5
105 Brunei 13603 C 5 5
106 Brunei 13604 G 5 5
107 Brunei 13605 C 5 5
108 Brunei 13606 T 5 5
109 Brunei 13607 T 5 5
110 Brunei 13608 C 5 5
111 Brunei 13609 C 5 5
112 Brunei 13610 A 5 5
113 Brunei 13611 A 5 5
114 Brunei 13612 G 5 5
115 Brunei 13613 A 5 5
116 Brunei 13614 A 5 5
117 Brunei 13615 A 5 5
118 Brunei 13616 A 5 5
119 Brunei 13617 G 5 5
120 Brunei 13618 G 5 5
121 Brunei 13619 A 5 5
122 Brunei 13620 C 5 5
123 Brunei 13621 G 5 5
124 Brunei 13622 A 5 5
125 Brunei 13623 A 5 5
126 Brunei 13624 G 5 5
127 Brunei 13625 A 5 5
128 Brunei 13626 T 5 5
129 Brunei 13627 G 5 5
130 Brunei 13628 A 5 5
131 Brunei 13629 C 5 5
132 Brunei 13630 A 5 5
133 Brunei 13631 A 5 5
134 Brunei 13632 T 5 5
135 Brunei 13633 T 5 5
136 Brunei 13634 T 5 5
137 Brunei 13635 A 5 5
138 Brunei 13636 A 5 5
139 Brunei 13637 T 5 5
140 Brunei 13638 T 5 5
141 Brunei 13639 G 5 5
142 Brunei 13640 A 5 5
143 Brunei 13641 T 5 5
144 Brunei 13642 T 5 5
145 Brunei 13643 C 5 5
146 Brunei 13644 T 5 5
147 Brunei 13645 T 5 5
148 Brunei 13646 A 5 5
149 Brunei 13647 C 5 5
150 Brunei 13648 T 5 5
151 Brunei 13649 T 5 5
152 Brunei 13650 T 5 5
153 Brunei 13651 G 5 5
154 Brunei 13652 T 5 5
155 Brunei 13653 A 5 5
156 Brunei 13654 G 5 5
157 Brunei 13655 T 5 5
158 Brunei 13656 T 5 5
159 Brunei 13657 A 5 5
160 Brunei 13658 A 5 5
161 Brunei 13659 G 5 5
162 Brunei 13660 A 5 5
163 Brunei 13661 G 5 5
164 Brunei 13662 A 5 5
165 Brunei 13663 C 5 5
166 Brunei 13664 A 5 5
167 Brunei 13665 C 5 5
168 Brunei 13666 A 5 5
169 Brunei 13667 C 5 5
170 Brunei 13668 T 5 5
171 Brunei 13669 T 5 5
172 Brunei 13670 T 5 5
173 Brunei 13671 C 5 5
174 Brunei 13672 T 5 5
175 Brunei 13673 C 5 5
176 Brunei 13674 T 5 5
177 Brunei 13675 A 5 5
178 Brunei 13676 A 5 5
179 Brunei 13677 C 5 5
180 Brunei 13678 T 5 5
181 Brunei 13679 A 5 5
182 Brunei 13680 C 5 5
183 Brunei 13681 C 5 5
184 Brunei 13682 A 5 5
185 Brunei 13683 A 5 5
186 Brunei 13684 C 5 5
187 Brunei 13685 A 5 5
188 Brunei 13686 T 5 5
189 Brunei 13687 G 5 5
190 Brunei 13688 A 5 5
191 Brunei 13689 A 5 5
192 Brunei 13690 G 5 5
193 Brunei 13691 A 5 5
194 Brunei 13692 A 5 5
195 Brunei 13693 A 5 5
196 Brunei 13694 C 5 5
197 Brunei 13695 A 5 5
198 Brunei 13696 A 5 5
199 Brunei 13697 T 5 5
200 Brunei 13698 T 5 5
201 Brunei 13699 T 5 5
202 Brunei 13700 A 5 5
203 Brunei 13701 T 5 5
204 Brunei 13702 A 5 5
205 Brunei 13703 A 5 5
206 Brunei 13704 T 5 5
207 Brunei 13705 T 5 5
208 Brunei 13706 T 5 5
209 Brunei 13707 A 5 5
210 Brunei 13708 C 5 5
211 Brunei 13709 T 5 5
212 Brunei 13710 T 5 5
213 Brunei 13711 A 5 5
214 Brunei 13712 A 5 5
215 Brunei 13713 G 5 5
216 Brunei 13714 G 5 5
217 Brunei 13715 A 5 5
218 Brunei 13716 T 5 5
219 Brunei 13717 T 5 5
220 Brunei 13718 G 5 5
221 Brunei 13719 T 5 5
222 Brunei 13720 C 5 5
223 Brunei 13721 C 5 5
224 Brunei 13722 A 5 5
225 Brunei 13723 G 5 5
226 Brunei 13724 C 5 5
227 Brunei 13725 T 5 5
228 Brunei 13726 G 5 5
229 Brunei 13727 T 5 5
230 Brunei 13728 T 5 5
231 Brunei 13729 G 5 5
232 Brunei 13730 C T 5 0 Leu4489Leu
233 Brunei 13731 T 5 5
234 Brunei 13732 A 5 5
235 Brunei 13733 A 5 5
236 Brunei 13734 A 5 5
237 Brunei 13735 C 5 5
238 Brunei 13736 A 5 5
239 Brunei 13737 T 5 5
240 Brunei 13738 G 5 5
241 Brunei 13739 A 5 5
242 Brunei 13740 C 5 5
243 Brunei 13741 T 5 5
244 Brunei 13742 T 5 5
245 Brunei 13743 C 5 5
246 Brunei 13744 T 5 5
247 Brunei 13745 T 5 5
248 Brunei 13746 T 5 5
249 Brunei 13747 A 5 5
250 Brunei 13748 A 5 5
251 Brunei 13749 G 5 5
252 Brunei 13750 T 5 5
253 Brunei 13751 T 5 5
254 Brunei 13752 T 5 5
255 Brunei 13753 A 5 5
256 Brunei 13754 G 5 5
257 Brunei 13755 A 5 5
258 Brunei 13756 A 5 5
259 Brunei 13757 T 5 5
260 Brunei 13758 A 5 5
261 Brunei 13759 G 5 5
262 Brunei 13760 A 5 5
263 Brunei 13761 C 5 5
264 Brunei 13762 G 5 5
265 Brunei 13763 G 5 5
266 Brunei 13764 T 5 5
267 Brunei 13765 G 5 5
268 Brunei 13766 A 5 5
269 Brunei 13767 C 5 5
270 Brunei 13768 A 5 5
271 Brunei 13769 T 5 5
272 Brunei 13770 G 5 5
273 Brunei 13771 G 5 5
274 Brunei 13772 T 5 5
275 Brunei 13773 A 5 5
276 Brunei 13774 C 5 5
277 Brunei 13775 C 5 5
278 Brunei 13776 A 5 5
279 Brunei 13777 C 5 5
280 Brunei 13778 A 5 5
281 Brunei 13779 T 5 5
282 Brunei 13780 A 5 5
283 Brunei 13781 T 5 5
284 Brunei 13782 A 5 5
285 Brunei 13783 T 5 5
286 Brunei 13784 C 5 5
287 Brunei 13785 A 5 5
288 Brunei 13786 C 5 5
289 Brunei 13787 G 5 5
290 Brunei 13788 T 5 5
291 Brunei 13789 C 5 5
292 Brunei 13790 A 5 5
293 Brunei 13791 A 5 5
294 Brunei 13792 C 5 5
295 Brunei 13793 G 5 5
296 Brunei 13794 T 5 5
297 Brunei 13795 C 5 5
298 Brunei 13796 T 5 5
299 Brunei 13797 T 5 5
300 Brunei 13798 A 5 5
301 Brunei 13799 C 5 5
302 Brunei 13800 T 5 5
303 Brunei 13801 A 5 5
304 Brunei 13802 A 5 5
305 Brunei 13803 A 5 5
306 Brunei 13804 T 5 5
307 Brunei 13805 A 5 5
308 Brunei 13806 C 5 5
309 Brunei 13807 A 5 5
310 Brunei 13808 C 5 5
311 Brunei 13809 A 5 5
312 Brunei 13810 A 5 5
313 Brunei 13811 T 5 5
314 Brunei 13812 G 5 5
315 Brunei 13813 G 5 5
316 Brunei 13814 C 5 5
317 Brunei 13815 A 5 5
318 Brunei 13816 G 5 5
319 Brunei 13817 A 5 5
320 Brunei 13818 C 5 5
321 Brunei 13819 C 5 5
322 Brunei 13820 T 5 5
323 Brunei 13821 C 5 5
324 Brunei 13822 G 5 5
325 Brunei 13823 T 5 5
326 Brunei 13824 C 5 5
327 Brunei 13825 T 5 5
328 Brunei 13826 A 5 5
329 Brunei 13827 T 5 5
330 Brunei 13828 G 5 5
331 Brunei 13829 C 5 5
332 Brunei 13830 T 5 5
333 Brunei 13831 T 5 5
334 Brunei 13832 T 5 5
335 Brunei 13833 A 5 5
336 Brunei 13834 A 5 5
337 Brunei 13835 G 5 5
338 Brunei 13836 G 5 5
339 Brunei 13837 C 5 5
340 Brunei 13838 A 5 5
341 Brunei 13839 T 5 5
342 Brunei 13840 T 5 5
343 Brunei 13841 T 5 5
344 Brunei 13842 T 5 5
345 Brunei 13843 G 5 5
346 Brunei 13844 A 5 5
347 Brunei 13845 T 5 5
348 Brunei 13846 G 5 5
349 Brunei 13847 A 5 5
350 Brunei 13848 A 5 5
351 Brunei 13849 G 5 5
352 Brunei 13850 G 5 5
353 Brunei 13851 T 5 5
354 Brunei 13852 A 5 5
355 Brunei 13853 A 5 5
356 Brunei 13854 T 5 5
357 Brunei 13855 T 5 5
358 Brunei 13856 G 5 5
359 Brunei 13857 T 5 5
360 Brunei 13858 G 5 5
361 Brunei 13859 A 5 5
362 Brunei 13860 C 5 5
363 Brunei 13861 A 5 5
364 Brunei 13862 C 5 5
365 Brunei 13863 A 5 5
366 Brunei 13864 T 5 5
367 Brunei 13865 T 5 5
368 Brunei 13866 A 5 5
369 Brunei 13867 A 5 5
370 Brunei 13868 A 5 5
371 Brunei 13869 A 5 5
372 Brunei 13870 G 5 5
373 Brunei 13871 A 5 5
374 Brunei 13872 A 5 5
375 Brunei 13873 A 5 5
376 Brunei 13874 T 5 5
377 Brunei 13875 A 5 5
378 Brunei 13876 C 5 5
379 Brunei 13877 T 5 5
380 Brunei 13878 T 5 5
381 Brunei 13879 G 5 5
382 Brunei 13880 T 5 5
383 Brunei 13881 C 5 5
384 Brunei 13882 A 5 5
385 Brunei 13883 C 5 5
386 Brunei 13884 A 5 5
387 Brunei 13885 T 5 5
388 Brunei 13886 A 5 5
389 Brunei 13887 C 5 5
390 Brunei 13888 A 5 5
391 Brunei 13889 A 5 5
392 Brunei 13890 T 5 5
393 Brunei 13891 T 5 5
394 Brunei 13892 G 5 5
395 Brunei 13893 T 5 5
396 Brunei 13894 T 5 5
397 Brunei 13895 G 5 5
398 Brunei 13896 T 5 5
399 Brunei 13897 G 5 5
400 Brunei 13898 A 5 5
401 Brunei 13899 T 5 5
402 Brunei 13900 G 5 5
403 Brunei 13901 A 5 5
404 Brunei 13902 T 5 5
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1289 Brunei 14787 T 5 5
1290 Brunei 14788 A 5 5
1291 Brunei 14789 T 5 5
1292 Brunei 14790 C 5 5
1293 Brunei 14791 A 5 5
1294 Brunei 14792 G 5 5
1295 Brunei 14793 C 5 5
1296 Brunei 14794 G 5 5
1297 Brunei 14795 A 5 5
1298 Brunei 14796 T 5 5
1299 Brunei 14797 T 5 5
1300 Brunei 14798 A 5 5
1301 Brunei 14799 T 5 5
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1723 Brunei 15221 T 5 5
1724 Brunei 15222 C 5 5
1725 Brunei 15223 T 5 5
1726 Brunei 15224 A 5 5
1727 Brunei 15225 T 5 5
1728 Brunei 15226 G 5 5
1729 Brunei 15227 G 5 5
1730 Brunei 15228 T 5 5
1731 Brunei 15229 G 5 5
1732 Brunei 15230 G 5 5
1733 Brunei 15231 T 5 5
1734 Brunei 15232 T 5 5
1735 Brunei 15233 G 5 5
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1739 Brunei 15237 C 5 5
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1741 Brunei 15239 A 5 5
1742 Brunei 15240 C 5 5
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1744 Brunei 15242 T 5 5
1745 Brunei 15243 G 5 5
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1757 Brunei 15255 T 5 5
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2581 Brunei 16079 T 5 5
2582 Brunei 16080 C 5 5
2583 Brunei 16081 T 5 5
2584 Brunei 16082 T 5 5
2585 Brunei 16083 T 5 5
2586 Brunei 16084 C 5 5
2587 Brunei 16085 A 5 5
2588 Brunei 16086 T 5 5
2589 Brunei 16087 T 5 5
2590 Brunei 16088 T 5 5
2591 Brunei 16089 G 5 5
2592 Brunei 16090 T 5 5
2593 Brunei 16091 A 5 5
2594 Brunei 16092 C 5 5
2595 Brunei 16093 T 5 5
2596 Brunei 16094 T 5 5
2597 Brunei 16095 A 5 5
2598 Brunei 16096 C 5 5
2599 Brunei 16097 A 5 5
2600 Brunei 16098 A 5 5
2601 Brunei 16099 T 5 5
2602 Brunei 16100 A 5 5
2603 Brunei 16101 C 5 5
2604 Brunei 16102 A 5 5
2605 Brunei 16103 T 5 5
2606 Brunei 16104 A 5 5
2607 Brunei 16105 A 5 5
2608 Brunei 16106 G 5 5
2609 Brunei 16107 A 5 5
2610 Brunei 16108 A 5 5
2611 Brunei 16109 A 5 5
2612 Brunei 16110 G 5 5
2613 Brunei 16111 C 5 5
2614 Brunei 16112 T 5 5
2615 Brunei 16113 A 5 5
2616 Brunei 16114 C 5 5
2617 Brunei 16115 A 5 5
2618 Brunei 16116 T 5 5
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2620 Brunei 16118 A 5 5
2621 Brunei 16119 T 5 5
2622 Brunei 16120 G 5 5
2623 Brunei 16121 A 5 5
2624 Brunei 16122 G 5 5
2625 Brunei 16123 T 5 5
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2627 Brunei 16125 A 5 5
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2630 Brunei 16128 A 5 5
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2636 Brunei 16134 C 5 5
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2640 Brunei 16138 T 5 5
2641 Brunei 16139 T 5 5
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