National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     174                                        
-     2,739                                        
?                                              
A     66                                        
C     81                                        
D     36                                        
E     54                                        
F     78                                        
G     48                                        
H     81                                        
I     237                                        
K     111                                        
L     487                   1                    
M     183                                        
N     105                                        
P     54                                        
Q     117                                        
R     80                                        
S     195                                        
T     222                                 1      
V     213                                        
W     21                                        
Y     96                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 13498 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 13499 C 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 13500 A 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 13501 C 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 13502 C 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 13503 G 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 13504 T 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 13505 G 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 13506 C 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 13507 G 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 13508 G 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 13509 C 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 13510 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 13511 C 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 13512 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 13513 G 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 13514 G 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 13515 C 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 13516 A 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 13517 C 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 13518 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 13519 A 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 13520 G 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 13521 T 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 13522 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 13523 C 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 13524 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 13525 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 13526 A 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 13527 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 13528 G 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 13529 T 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 13530 C 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 13531 G 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 13532 T 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 13533 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 13534 T 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 13535 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 13536 C 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 13537 A 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 13538 G 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 13539 G 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 13540 G 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 13541 C 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 13542 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 13543 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 13544 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 13545 T 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 13546 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 13547 A 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 13548 C 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 13549 A 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 13550 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 13551 C 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 13552 T 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 13553 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 13554 C 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 13555 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 13556 A 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 13557 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 13558 G 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 13559 A 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 13560 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 13561 A 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 13562 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 13563 A 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 13564 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 13565 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 13566 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 13567 G 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 13568 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 13569 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 13570 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 13571 G 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 13572 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 13573 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 13574 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 13575 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 13576 G 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 13577 C 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 13578 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 13579 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 13580 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 13581 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 13582 T 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 13583 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 13584 C 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 13585 C 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 13586 T 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 13587 A 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 13588 A 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 13589 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 13590 A 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 13591 A 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 13592 C 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 13593 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 13594 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 13595 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 13596 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 13597 T 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 13598 G 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 13599 T 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 13600 T 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 13601 G 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 13602 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 13603 C 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 13604 G 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 13605 C 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 13606 T 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 13607 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 13608 C 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 13609 C 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 13610 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 13611 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 13612 G 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 13613 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 13614 A 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 13615 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 13616 A 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 13617 G 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 13618 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 13619 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 13620 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 13621 G 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 13622 A 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 13623 A 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 13624 G 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 13625 A 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 13626 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 13627 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 13628 A 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 13629 C 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 13630 A 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 13631 A 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 13632 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 13633 T 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 13634 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 13635 A 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 13636 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 13637 T 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 13638 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 13639 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 13640 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 13641 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 13642 T 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 13643 C 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 13644 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 13645 T 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 13646 A 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 13647 C 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 13648 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 13649 T 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 13650 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 13651 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 13652 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 13653 A 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 13654 G 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 13655 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 13656 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 13657 A 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 13658 A 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 13659 G 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 13660 A 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 13661 G 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 13662 A 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 13663 C 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 13664 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 13665 C 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 13666 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 13667 C 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 13668 T 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 13669 T 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 13670 T 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 13671 C 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 13672 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 13673 C 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 13674 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 13675 A 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 13676 A 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 13677 C 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 13678 T 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 13679 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 13680 C 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 13681 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 13682 A 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 13683 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 13684 C 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 13685 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 13686 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 13687 G 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 13688 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 13689 A 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 13690 G 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 13691 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 13692 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 13693 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 13694 C 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 13695 A 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 13696 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 13697 T 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 13698 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 13699 T 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 13700 A 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 13701 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 13702 A 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 13703 A 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 13704 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 13705 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 13706 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 13707 A 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 13708 C 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 13709 T 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 13710 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 13711 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 13712 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 13713 G 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 13714 G 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 13715 A 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 13716 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 13717 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 13718 G 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 13719 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 13720 C 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 13721 C 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 13722 A 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 13723 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 13724 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 13725 T 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 13726 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 13727 T 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 13728 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 13729 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 13730 C 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 13731 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 13732 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 13733 A 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 13734 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 13735 C 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 13736 A 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 13737 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 13738 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 13739 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 13740 C 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 13741 T 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 13742 T 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 13743 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 13744 T 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 13745 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 13746 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 13747 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 13748 A 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 13749 G 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 13750 T 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 13751 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 13752 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 13753 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 13754 G 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 13755 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 13756 A 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 13757 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 13758 A 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 13759 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 13760 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 13761 C 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 13762 G 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 13763 G 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 13764 T 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 13765 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 13766 A 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 13767 C 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 13768 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 13769 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 13770 G 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 13771 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 13772 T 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 13773 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 13774 C 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 13775 C 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 13776 A 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 13777 C 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 13778 A 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 13779 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 13780 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 13781 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 13782 A 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 13783 T 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 13784 C 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 13785 A 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 13786 C 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 13787 G 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 13788 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 13789 C 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 13790 A 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 13791 A 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 13792 C 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 13793 G 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 13794 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 13795 C 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 13796 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 13797 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 13798 A 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 13799 C 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 13800 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 13801 A 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 13802 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 13803 A 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 13804 T 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 13805 A 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 13806 C 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 13807 A 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 13808 C 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 13809 A 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 13810 A 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 13811 T 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 13812 G 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 13813 G 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 13814 C 1 1
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671 Antigua_and_Barbuda 14169 T 1 1
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1701 Antigua_and_Barbuda 15199 G 1 1
1702 Antigua_and_Barbuda 15200 T 1 1
1703 Antigua_and_Barbuda 15201 A 1 1
1704 Antigua_and_Barbuda 15202 G 1 1
1705 Antigua_and_Barbuda 15203 T 1 1
1706 Antigua_and_Barbuda 15204 A 1 1
1707 Antigua_and_Barbuda 15205 A 1 1
1708 Antigua_and_Barbuda 15206 T 1 1
1709 Antigua_and_Barbuda 15207 T 1 1
1710 Antigua_and_Barbuda 15208 G 1 1
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2718 Antigua_and_Barbuda 16216 A 1 1
2719 Antigua_and_Barbuda 16217 C 1 1
2720 Antigua_and_Barbuda 16218 A 1 1
2721 Antigua_and_Barbuda 16219 C 1 1
2722 Antigua_and_Barbuda 16220 C 1 1
2723 Antigua_and_Barbuda 16221 G 1 1
2724 Antigua_and_Barbuda 16222 C 1 1
2725 Antigua_and_Barbuda 16223 A 1 1
2726 Antigua_and_Barbuda 16224 T 1 1
2727 Antigua_and_Barbuda 16225 A 1 1
2728 Antigua_and_Barbuda 16226 C 1 1
2729 Antigua_and_Barbuda 16227 A 1 1
2730 Antigua_and_Barbuda 16228 G 1 1
2731 Antigua_and_Barbuda 16229 T 1 1
2732 Antigua_and_Barbuda 16230 C 1 1
2733 Antigua_and_Barbuda 16231 T 1 1
2734 Antigua_and_Barbuda 16232 T 1 1
2735 Antigua_and_Barbuda 16233 A 1 1
2736 Antigua_and_Barbuda 16234 C 1 1
2737 Antigua_and_Barbuda 16235 A 1 1
2738 Antigua_and_Barbuda 16236 G 1 1