National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     174                                        
-     2,739                                        
?                                              
A     66                                        
C     81                                        
D     36                                        
E     54                                        
F     78                                        
G     48                                        
H     81                                        
I     237                                        
K     111                                        
L     487                   1                    
M     183                                        
N     105                                        
P     54                                        
Q     117                                        
R     80                                        
S     195                                        
T     222                                        
V     213                                        
W     21                                        
Y     96                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Andorra 13498 A 1 1
1 Andorra 13499 C 1 1
2 Andorra 13500 A 1 1
3 Andorra 13501 C 1 1
4 Andorra 13502 C 1 1
5 Andorra 13503 G 1 1
6 Andorra 13504 T 1 1
7 Andorra 13505 G 1 1
8 Andorra 13506 C 1 1
9 Andorra 13507 G 1 1
10 Andorra 13508 G 1 1
11 Andorra 13509 C 1 1
12 Andorra 13510 A 1 1
13 Andorra 13511 C 1 1
14 Andorra 13512 A 1 1
15 Andorra 13513 G 1 1
16 Andorra 13514 G 1 1
17 Andorra 13515 C 1 1
18 Andorra 13516 A 1 1
19 Andorra 13517 C 1 1
20 Andorra 13518 T 1 1
21 Andorra 13519 A 1 1
22 Andorra 13520 G 1 1
23 Andorra 13521 T 1 1
24 Andorra 13522 A 1 1
25 Andorra 13523 C 1 1
26 Andorra 13524 T 1 1
27 Andorra 13525 G 1 1
28 Andorra 13526 A 1 1
29 Andorra 13527 T 1 1
30 Andorra 13528 G 1 1
31 Andorra 13529 T 1 1
32 Andorra 13530 C 1 1
33 Andorra 13531 G 1 1
34 Andorra 13532 T 1 1
35 Andorra 13533 A 1 1
36 Andorra 13534 T 1 1
37 Andorra 13535 A 1 1
38 Andorra 13536 C 1 1
39 Andorra 13537 A 1 1
40 Andorra 13538 G 1 1
41 Andorra 13539 G 1 1
42 Andorra 13540 G 1 1
43 Andorra 13541 C 1 1
44 Andorra 13542 T 1 1
45 Andorra 13543 T 1 1
46 Andorra 13544 T 1 1
47 Andorra 13545 T 1 1
48 Andorra 13546 G 1 1
49 Andorra 13547 A 1 1
50 Andorra 13548 C 1 1
51 Andorra 13549 A 1 1
52 Andorra 13550 T 1 1
53 Andorra 13551 C 1 1
54 Andorra 13552 T 1 1
55 Andorra 13553 A 1 1
56 Andorra 13554 C 1 1
57 Andorra 13555 A 1 1
58 Andorra 13556 A 1 1
59 Andorra 13557 T 1 1
60 Andorra 13558 G 1 1
61 Andorra 13559 A 1 1
62 Andorra 13560 T 1 1
63 Andorra 13561 A 1 1
64 Andorra 13562 A 1 1
65 Andorra 13563 A 1 1
66 Andorra 13564 G 1 1
67 Andorra 13565 T 1 1
68 Andorra 13566 A 1 1
69 Andorra 13567 G 1 1
70 Andorra 13568 C 1 1
71 Andorra 13569 T 1 1
72 Andorra 13570 G 1 1
73 Andorra 13571 G 1 1
74 Andorra 13572 T 1 1
75 Andorra 13573 T 1 1
76 Andorra 13574 T 1 1
77 Andorra 13575 T 1 1
78 Andorra 13576 G 1 1
79 Andorra 13577 C 1 1
80 Andorra 13578 T 1 1
81 Andorra 13579 A 1 1
82 Andorra 13580 A 1 1
83 Andorra 13581 A 1 1
84 Andorra 13582 T 1 1
85 Andorra 13583 T 1 1
86 Andorra 13584 C 1 1
87 Andorra 13585 C 1 1
88 Andorra 13586 T 1 1
89 Andorra 13587 A 1 1
90 Andorra 13588 A 1 1
91 Andorra 13589 A 1 1
92 Andorra 13590 A 1 1
93 Andorra 13591 A 1 1
94 Andorra 13592 C 1 1
95 Andorra 13593 T 1 1
96 Andorra 13594 A 1 1
97 Andorra 13595 A 1 1
98 Andorra 13596 T 1 1
99 Andorra 13597 T 1 1
100 Andorra 13598 G 1 1
101 Andorra 13599 T 1 1
102 Andorra 13600 T 1 1
103 Andorra 13601 G 1 1
104 Andorra 13602 T 1 1
105 Andorra 13603 C 1 1
106 Andorra 13604 G 1 1
107 Andorra 13605 C 1 1
108 Andorra 13606 T 1 1
109 Andorra 13607 T 1 1
110 Andorra 13608 C 1 1
111 Andorra 13609 C 1 1
112 Andorra 13610 A 1 1
113 Andorra 13611 A 1 1
114 Andorra 13612 G 1 1
115 Andorra 13613 A 1 1
116 Andorra 13614 A 1 1
117 Andorra 13615 A 1 1
118 Andorra 13616 A 1 1
119 Andorra 13617 G 1 1
120 Andorra 13618 G 1 1
121 Andorra 13619 A 1 1
122 Andorra 13620 C 1 1
123 Andorra 13621 G 1 1
124 Andorra 13622 A 1 1
125 Andorra 13623 A 1 1
126 Andorra 13624 G 1 1
127 Andorra 13625 A 1 1
128 Andorra 13626 T 1 1
129 Andorra 13627 G 1 1
130 Andorra 13628 A 1 1
131 Andorra 13629 C 1 1
132 Andorra 13630 A 1 1
133 Andorra 13631 A 1 1
134 Andorra 13632 T 1 1
135 Andorra 13633 T 1 1
136 Andorra 13634 T 1 1
137 Andorra 13635 A 1 1
138 Andorra 13636 A 1 1
139 Andorra 13637 T 1 1
140 Andorra 13638 T 1 1
141 Andorra 13639 G 1 1
142 Andorra 13640 A 1 1
143 Andorra 13641 T 1 1
144 Andorra 13642 T 1 1
145 Andorra 13643 C 1 1
146 Andorra 13644 T 1 1
147 Andorra 13645 T 1 1
148 Andorra 13646 A 1 1
149 Andorra 13647 C 1 1
150 Andorra 13648 T 1 1
151 Andorra 13649 T 1 1
152 Andorra 13650 T 1 1
153 Andorra 13651 G 1 1
154 Andorra 13652 T 1 1
155 Andorra 13653 A 1 1
156 Andorra 13654 G 1 1
157 Andorra 13655 T 1 1
158 Andorra 13656 T 1 1
159 Andorra 13657 A 1 1
160 Andorra 13658 A 1 1
161 Andorra 13659 G 1 1
162 Andorra 13660 A 1 1
163 Andorra 13661 G 1 1
164 Andorra 13662 A 1 1
165 Andorra 13663 C 1 1
166 Andorra 13664 A 1 1
167 Andorra 13665 C 1 1
168 Andorra 13666 A 1 1
169 Andorra 13667 C 1 1
170 Andorra 13668 T 1 1
171 Andorra 13669 T 1 1
172 Andorra 13670 T 1 1
173 Andorra 13671 C 1 1
174 Andorra 13672 T 1 1
175 Andorra 13673 C 1 1
176 Andorra 13674 T 1 1
177 Andorra 13675 A 1 1
178 Andorra 13676 A 1 1
179 Andorra 13677 C 1 1
180 Andorra 13678 T 1 1
181 Andorra 13679 A 1 1
182 Andorra 13680 C 1 1
183 Andorra 13681 C 1 1
184 Andorra 13682 A 1 1
185 Andorra 13683 A 1 1
186 Andorra 13684 C 1 1
187 Andorra 13685 A 1 1
188 Andorra 13686 T 1 1
189 Andorra 13687 G 1 1
190 Andorra 13688 A 1 1
191 Andorra 13689 A 1 1
192 Andorra 13690 G 1 1
193 Andorra 13691 A 1 1
194 Andorra 13692 A 1 1
195 Andorra 13693 A 1 1
196 Andorra 13694 C 1 1
197 Andorra 13695 A 1 1
198 Andorra 13696 A 1 1
199 Andorra 13697 T 1 1
200 Andorra 13698 T 1 1
201 Andorra 13699 T 1 1
202 Andorra 13700 A 1 1
203 Andorra 13701 T 1 1
204 Andorra 13702 A 1 1
205 Andorra 13703 A 1 1
206 Andorra 13704 T 1 1
207 Andorra 13705 T 1 1
208 Andorra 13706 T 1 1
209 Andorra 13707 A 1 1
210 Andorra 13708 C 1 1
211 Andorra 13709 T 1 1
212 Andorra 13710 T 1 1
213 Andorra 13711 A 1 1
214 Andorra 13712 A 1 1
215 Andorra 13713 G 1 1
216 Andorra 13714 G 1 1
217 Andorra 13715 A 1 1
218 Andorra 13716 T 1 1
219 Andorra 13717 T 1 1
220 Andorra 13718 G 1 1
221 Andorra 13719 T 1 1
222 Andorra 13720 C 1 1
223 Andorra 13721 C 1 1
224 Andorra 13722 A 1 1
225 Andorra 13723 G 1 1
226 Andorra 13724 C 1 1
227 Andorra 13725 T 1 1
228 Andorra 13726 G 1 1
229 Andorra 13727 T 1 1
230 Andorra 13728 T 1 1
231 Andorra 13729 G 1 1
232 Andorra 13730 C 1 1
233 Andorra 13731 T 1 1
234 Andorra 13732 A 1 1
235 Andorra 13733 A 1 1
236 Andorra 13734 A 1 1
237 Andorra 13735 C 1 1
238 Andorra 13736 A 1 1
239 Andorra 13737 T 1 1
240 Andorra 13738 G 1 1
241 Andorra 13739 A 1 1
242 Andorra 13740 C 1 1
243 Andorra 13741 T 1 1
244 Andorra 13742 T 1 1
245 Andorra 13743 C 1 1
246 Andorra 13744 T 1 1
247 Andorra 13745 T 1 1
248 Andorra 13746 T 1 1
249 Andorra 13747 A 1 1
250 Andorra 13748 A 1 1
251 Andorra 13749 G 1 1
252 Andorra 13750 T 1 1
253 Andorra 13751 T 1 1
254 Andorra 13752 T 1 1
255 Andorra 13753 A 1 1
256 Andorra 13754 G 1 1
257 Andorra 13755 A 1 1
258 Andorra 13756 A 1 1
259 Andorra 13757 T 1 1
260 Andorra 13758 A 1 1
261 Andorra 13759 G 1 1
262 Andorra 13760 A 1 1
263 Andorra 13761 C 1 1
264 Andorra 13762 G 1 1
265 Andorra 13763 G 1 1
266 Andorra 13764 T 1 1
267 Andorra 13765 G 1 1
268 Andorra 13766 A 1 1
269 Andorra 13767 C 1 1
270 Andorra 13768 A 1 1
271 Andorra 13769 T 1 1
272 Andorra 13770 G 1 1
273 Andorra 13771 G 1 1
274 Andorra 13772 T 1 1
275 Andorra 13773 A 1 1
276 Andorra 13774 C 1 1
277 Andorra 13775 C 1 1
278 Andorra 13776 A 1 1
279 Andorra 13777 C 1 1
280 Andorra 13778 A 1 1
281 Andorra 13779 T 1 1
282 Andorra 13780 A 1 1
283 Andorra 13781 T 1 1
284 Andorra 13782 A 1 1
285 Andorra 13783 T 1 1
286 Andorra 13784 C 1 1
287 Andorra 13785 A 1 1
288 Andorra 13786 C 1 1
289 Andorra 13787 G 1 1
290 Andorra 13788 T 1 1
291 Andorra 13789 C 1 1
292 Andorra 13790 A 1 1
293 Andorra 13791 A 1 1
294 Andorra 13792 C 1 1
295 Andorra 13793 G 1 1
296 Andorra 13794 T 1 1
297 Andorra 13795 C 1 1
298 Andorra 13796 T 1 1
299 Andorra 13797 T 1 1
300 Andorra 13798 A 1 1
301 Andorra 13799 C 1 1
302 Andorra 13800 T 1 1
303 Andorra 13801 A 1 1
304 Andorra 13802 A 1 1
305 Andorra 13803 A 1 1
306 Andorra 13804 T 1 1
307 Andorra 13805 A 1 1
308 Andorra 13806 C 1 1
309 Andorra 13807 A 1 1
310 Andorra 13808 C 1 1
311 Andorra 13809 A 1 1
312 Andorra 13810 A 1 1
313 Andorra 13811 T 1 1
314 Andorra 13812 G 1 1
315 Andorra 13813 G 1 1
316 Andorra 13814 C 1 1
317 Andorra 13815 A 1 1
318 Andorra 13816 G 1 1
319 Andorra 13817 A 1 1
320 Andorra 13818 C 1 1
321 Andorra 13819 C 1 1
322 Andorra 13820 T 1 1
323 Andorra 13821 C 1 1
324 Andorra 13822 G 1 1
325 Andorra 13823 T 1 1
326 Andorra 13824 C 1 1
327 Andorra 13825 T 1 1
328 Andorra 13826 A 1 1
329 Andorra 13827 T 1 1
330 Andorra 13828 G 1 1
331 Andorra 13829 C 1 1
332 Andorra 13830 T 1 1
333 Andorra 13831 T 1 1
334 Andorra 13832 T 1 1
335 Andorra 13833 A 1 1
336 Andorra 13834 A 1 1
337 Andorra 13835 G 1 1
338 Andorra 13836 G 1 1
339 Andorra 13837 C 1 1
340 Andorra 13838 A 1 1
341 Andorra 13839 T 1 1
342 Andorra 13840 T 1 1
343 Andorra 13841 T 1 1
344 Andorra 13842 T 1 1
345 Andorra 13843 G 1 1
346 Andorra 13844 A 1 1
347 Andorra 13845 T 1 1
348 Andorra 13846 G 1 1
349 Andorra 13847 A 1 1
350 Andorra 13848 A 1 1
351 Andorra 13849 G 1 1
352 Andorra 13850 G 1 1
353 Andorra 13851 T 1 1
354 Andorra 13852 A 1 1
355 Andorra 13853 A 1 1
356 Andorra 13854 T 1 1
357 Andorra 13855 T 1 1
358 Andorra 13856 G 1 1
359 Andorra 13857 T 1 1
360 Andorra 13858 G 1 1
361 Andorra 13859 A 1 1
362 Andorra 13860 C 1 1
363 Andorra 13861 A 1 1
364 Andorra 13862 C 1 1
365 Andorra 13863 A 1 1
366 Andorra 13864 T 1 1
367 Andorra 13865 T 1 1
368 Andorra 13866 A 1 1
369 Andorra 13867 A 1 1
370 Andorra 13868 A 1 1
371 Andorra 13869 A 1 1
372 Andorra 13870 G 1 1
373 Andorra 13871 A 1 1
374 Andorra 13872 A 1 1
375 Andorra 13873 A 1 1
376 Andorra 13874 T 1 1
377 Andorra 13875 A 1 1
378 Andorra 13876 C 1 1
379 Andorra 13877 T 1 1
380 Andorra 13878 T 1 1
381 Andorra 13879 G 1 1
382 Andorra 13880 T 1 1
383 Andorra 13881 C 1 1
384 Andorra 13882 A 1 1
385 Andorra 13883 C 1 1
386 Andorra 13884 A 1 1
387 Andorra 13885 T 1 1
388 Andorra 13886 A 1 1
389 Andorra 13887 C 1 1
390 Andorra 13888 A 1 1
391 Andorra 13889 A 1 1
392 Andorra 13890 T 1 1
393 Andorra 13891 T 1 1
394 Andorra 13892 G 1 1
395 Andorra 13893 T 1 1
396 Andorra 13894 T 1 1
397 Andorra 13895 G 1 1
398 Andorra 13896 T 1 1
399 Andorra 13897 G 1 1
400 Andorra 13898 A 1 1
401 Andorra 13899 T 1 1
402 Andorra 13900 G 1 1
403 Andorra 13901 A 1 1
404 Andorra 13902 T 1 1
405 Andorra 13903 G 1 1
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1724 Andorra 15222 C 1 1
1725 Andorra 15223 T 1 1
1726 Andorra 15224 A 1 1
1727 Andorra 15225 T 1 1
1728 Andorra 15226 G 1 1
1729 Andorra 15227 G 1 1
1730 Andorra 15228 T 1 1
1731 Andorra 15229 G 1 1
1732 Andorra 15230 G 1 1
1733 Andorra 15231 T 1 1
1734 Andorra 15232 T 1 1
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2582 Andorra 16080 C 1 1
2583 Andorra 16081 T 1 1
2584 Andorra 16082 T 1 1
2585 Andorra 16083 T 1 1
2586 Andorra 16084 C 1 1
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2588 Andorra 16086 T 1 1
2589 Andorra 16087 T 1 1
2590 Andorra 16088 T 1 1
2591 Andorra 16089 G 1 1
2592 Andorra 16090 T 1 1
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2594 Andorra 16092 C 1 1
2595 Andorra 16093 T 1 1
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