National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A D E F H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                    
-     186                                    
?                                          
A     3                                    
D     12                                    
E     16                                    
F     9                                    
H     3                                    
I     30           1                        
K     12                                    
L     24                                    
M     9                                    
N     12                                    
P     3                                    
Q     9                                    
R     3                                    
S     12                                    
T     9                                    
V     9                                    
W     3                                    
Y     6                                    

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Bosnia_and_Herzegovina 27202 A 33 33
1 Bosnia_and_Herzegovina 27203 T 33 33
2 Bosnia_and_Herzegovina 27204 G 33 33
3 Bosnia_and_Herzegovina 27205 T 33 33
4 Bosnia_and_Herzegovina 27206 T 33 33
5 Bosnia_and_Herzegovina 27207 T 33 33
6 Bosnia_and_Herzegovina 27208 C 33 33
7 Bosnia_and_Herzegovina 27209 A 33 33
8 Bosnia_and_Herzegovina 27210 T 33 33
9 Bosnia_and_Herzegovina 27211 C 33 33
10 Bosnia_and_Herzegovina 27212 T 33 33
11 Bosnia_and_Herzegovina 27213 C 33 33
12 Bosnia_and_Herzegovina 27214 G 33 33
13 Bosnia_and_Herzegovina 27215 T 33 33
14 Bosnia_and_Herzegovina 27216 T 33 33
15 Bosnia_and_Herzegovina 27217 G 33 33
16 Bosnia_and_Herzegovina 27218 A 33 33
17 Bosnia_and_Herzegovina 27219 C 33 33
18 Bosnia_and_Herzegovina 27220 T 33 33
19 Bosnia_and_Herzegovina 27221 T 33 33
20 Bosnia_and_Herzegovina 27222 T 33 33
21 Bosnia_and_Herzegovina 27223 C 33 33
22 Bosnia_and_Herzegovina 27224 A 33 33
23 Bosnia_and_Herzegovina 27225 G 33 33
24 Bosnia_and_Herzegovina 27226 G 33 33
25 Bosnia_and_Herzegovina 27227 T 33 33
26 Bosnia_and_Herzegovina 27228 T 33 33
27 Bosnia_and_Herzegovina 27229 A 33 33
28 Bosnia_and_Herzegovina 27230 C 33 33
29 Bosnia_and_Herzegovina 27231 T 33 33
30 Bosnia_and_Herzegovina 27232 A 33 33
31 Bosnia_and_Herzegovina 27233 T 33 33
32 Bosnia_and_Herzegovina 27234 A 33 33
33 Bosnia_and_Herzegovina 27235 G 33 33
34 Bosnia_and_Herzegovina 27236 C 33 33
35 Bosnia_and_Herzegovina 27237 A 33 33
36 Bosnia_and_Herzegovina 27238 G 33 33
37 Bosnia_and_Herzegovina 27239 A 33 33
38 Bosnia_and_Herzegovina 27240 G 33 33
39 Bosnia_and_Herzegovina 27241 A 33 33
40 Bosnia_and_Herzegovina 27242 T 33 33
41 Bosnia_and_Herzegovina 27243 A 33 33
42 Bosnia_and_Herzegovina 27244 T 33 33
43 Bosnia_and_Herzegovina 27245 T 33 33
44 Bosnia_and_Herzegovina 27246 A 33 33
45 Bosnia_and_Herzegovina 27247 C 33 33
46 Bosnia_and_Herzegovina 27248 T 33 33
47 Bosnia_and_Herzegovina 27249 A 33 33
48 Bosnia_and_Herzegovina 27250 A 33 33
49 Bosnia_and_Herzegovina 27251 T 33 33
50 Bosnia_and_Herzegovina 27252 T 33 33
51 Bosnia_and_Herzegovina 27253 A 33 33
52 Bosnia_and_Herzegovina 27254 T 33 33
53 Bosnia_and_Herzegovina 27255 T 33 33
54 Bosnia_and_Herzegovina 27256 A 33 33
55 Bosnia_and_Herzegovina 27257 T 33 33
56 Bosnia_and_Herzegovina 27258 G 33 33
57 Bosnia_and_Herzegovina 27259 A 33 33
58 Bosnia_and_Herzegovina 27260 G 33 33
59 Bosnia_and_Herzegovina 27261 G 33 33
60 Bosnia_and_Herzegovina 27262 A 33 33
61 Bosnia_and_Herzegovina 27263 C 33 33
62 Bosnia_and_Herzegovina 27264 T 33 33
63 Bosnia_and_Herzegovina 27265 T 33 33
64 Bosnia_and_Herzegovina 27266 T 33 33
65 Bosnia_and_Herzegovina 27267 T 33 33
66 Bosnia_and_Herzegovina 27268 A 33 33
67 Bosnia_and_Herzegovina 27269 A 33 33
68 Bosnia_and_Herzegovina 27270 A 33 33
69 Bosnia_and_Herzegovina 27271 G 33 33
70 Bosnia_and_Herzegovina 27272 T 33 33
71 Bosnia_and_Herzegovina 27273 T 33 33
72 Bosnia_and_Herzegovina 27274 T 33 33
73 Bosnia_and_Herzegovina 27275 C 33 33
74 Bosnia_and_Herzegovina 27276 C 33 33
75 Bosnia_and_Herzegovina 27277 A 33 33
76 Bosnia_and_Herzegovina 27278 T 33 33
77 Bosnia_and_Herzegovina 27279 T 33 33
78 Bosnia_and_Herzegovina 27280 T 33 33
79 Bosnia_and_Herzegovina 27281 G 33 33
80 Bosnia_and_Herzegovina 27282 G 33 33
81 Bosnia_and_Herzegovina 27283 A 33 33
82 Bosnia_and_Herzegovina 27284 A 33 33
83 Bosnia_and_Herzegovina 27285 T 33 33
84 Bosnia_and_Herzegovina 27286 C 33 33
85 Bosnia_and_Herzegovina 27287 T 33 33
86 Bosnia_and_Herzegovina 27288 T 33 33
87 Bosnia_and_Herzegovina 27289 G 33 33
88 Bosnia_and_Herzegovina 27290 A 33 33
89 Bosnia_and_Herzegovina 27291 T 33 33
90 Bosnia_and_Herzegovina 27292 T 33 33
91 Bosnia_and_Herzegovina 27293 A 33 33
92 Bosnia_and_Herzegovina 27294 C 33 33
93 Bosnia_and_Herzegovina 27295 A 33 33
94 Bosnia_and_Herzegovina 27296 T 33 33
95 Bosnia_and_Herzegovina 27297 C T 33 32 Ile32Ile
96 Bosnia_and_Herzegovina 27298 A 33 33
97 Bosnia_and_Herzegovina 27299 T 33 33
98 Bosnia_and_Herzegovina 27300 A 33 33
99 Bosnia_and_Herzegovina 27301 A 33 33
100 Bosnia_and_Herzegovina 27302 A 33 33
101 Bosnia_and_Herzegovina 27303 C 33 33
102 Bosnia_and_Herzegovina 27304 C 33 33
103 Bosnia_and_Herzegovina 27305 T 33 33
104 Bosnia_and_Herzegovina 27306 C 33 33
105 Bosnia_and_Herzegovina 27307 A 33 33
106 Bosnia_and_Herzegovina 27308 T 33 33
107 Bosnia_and_Herzegovina 27309 A 33 33
108 Bosnia_and_Herzegovina 27310 A 33 33
109 Bosnia_and_Herzegovina 27311 T 33 33
110 Bosnia_and_Herzegovina 27312 T 33 33
111 Bosnia_and_Herzegovina 27313 A 33 33
112 Bosnia_and_Herzegovina 27314 A 33 33
113 Bosnia_and_Herzegovina 27315 A 33 33
114 Bosnia_and_Herzegovina 27316 A 33 33
115 Bosnia_and_Herzegovina 27317 A 33 33
116 Bosnia_and_Herzegovina 27318 T 33 33
117 Bosnia_and_Herzegovina 27319 T 33 33
118 Bosnia_and_Herzegovina 27320 T 33 33
119 Bosnia_and_Herzegovina 27321 A 33 33
120 Bosnia_and_Herzegovina 27322 T 33 33
121 Bosnia_and_Herzegovina 27323 C 33 33
122 Bosnia_and_Herzegovina 27324 T 33 33
123 Bosnia_and_Herzegovina 27325 A 33 33
124 Bosnia_and_Herzegovina 27326 A 33 33
125 Bosnia_and_Herzegovina 27327 G 33 33
126 Bosnia_and_Herzegovina 27328 T 33 33
127 Bosnia_and_Herzegovina 27329 C 33 33
128 Bosnia_and_Herzegovina 27330 A 33 33
129 Bosnia_and_Herzegovina 27331 C 33 33
130 Bosnia_and_Herzegovina 27332 T 33 33
131 Bosnia_and_Herzegovina 27333 A 33 33
132 Bosnia_and_Herzegovina 27334 A 33 33
133 Bosnia_and_Herzegovina 27335 C 33 33
134 Bosnia_and_Herzegovina 27336 T 33 33
135 Bosnia_and_Herzegovina 27337 G 33 33
136 Bosnia_and_Herzegovina 27338 A 33 33
137 Bosnia_and_Herzegovina 27339 G 33 33
138 Bosnia_and_Herzegovina 27340 A 33 33
139 Bosnia_and_Herzegovina 27341 A 33 33
140 Bosnia_and_Herzegovina 27342 T 33 33
141 Bosnia_and_Herzegovina 27343 A 33 33
142 Bosnia_and_Herzegovina 27344 A 33 33
143 Bosnia_and_Herzegovina 27345 A 33 33
144 Bosnia_and_Herzegovina 27346 T 33 33
145 Bosnia_and_Herzegovina 27347 A 33 33
146 Bosnia_and_Herzegovina 27348 T 33 33
147 Bosnia_and_Herzegovina 27349 T 33 33
148 Bosnia_and_Herzegovina 27350 C 33 33
149 Bosnia_and_Herzegovina 27351 T 33 33
150 Bosnia_and_Herzegovina 27352 C 33 33
151 Bosnia_and_Herzegovina 27353 A 33 33
152 Bosnia_and_Herzegovina 27354 A 33 33
153 Bosnia_and_Herzegovina 27355 T 33 33
154 Bosnia_and_Herzegovina 27356 T 33 33
155 Bosnia_and_Herzegovina 27357 A 33 33
156 Bosnia_and_Herzegovina 27358 G 33 33
157 Bosnia_and_Herzegovina 27359 A 33 33
158 Bosnia_and_Herzegovina 27360 T 33 33
159 Bosnia_and_Herzegovina 27361 G 33 33
160 Bosnia_and_Herzegovina 27362 A 33 33
161 Bosnia_and_Herzegovina 27363 A 33 33
162 Bosnia_and_Herzegovina 27364 G 33 33
163 Bosnia_and_Herzegovina 27365 A 33 33
164 Bosnia_and_Herzegovina 27366 G 33 33
165 Bosnia_and_Herzegovina 27367 C 33 33
166 Bosnia_and_Herzegovina 27368 A 33 33
167 Bosnia_and_Herzegovina 27369 A 33 33
168 Bosnia_and_Herzegovina 27370 C 33 33
169 Bosnia_and_Herzegovina 27371 C 33 33
170 Bosnia_and_Herzegovina 27372 A 33 33
171 Bosnia_and_Herzegovina 27373 A 33 33
172 Bosnia_and_Herzegovina 27374 T 33 33
173 Bosnia_and_Herzegovina 27375 G 33 33
174 Bosnia_and_Herzegovina 27376 G 33 33
175 Bosnia_and_Herzegovina 27377 A 33 33
176 Bosnia_and_Herzegovina 27378 G 33 33
177 Bosnia_and_Herzegovina 27379 A 33 33
178 Bosnia_and_Herzegovina 27380 T 33 33
179 Bosnia_and_Herzegovina 27381 T 33 33
180 Bosnia_and_Herzegovina 27382 G 33 33
181 Bosnia_and_Herzegovina 27383 A 33 33
182 Bosnia_and_Herzegovina 27384 T 33 33
183 Bosnia_and_Herzegovina 27385 T 33 33
184 Bosnia_and_Herzegovina 27386 A 33 33
185 Bosnia_and_Herzegovina 27387 A 33 33