National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A D E F H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                    
-     186                                    
?                                          
A     3                                    
D     12                                    
E     16                                    
F     9                                    
H     3                                    
I     30                                    
K     12                                    
L     24                                    
M     9                                    
N     12                                    
P     3                                    
Q     9                                    
R     3                                    
S     12                                    
T     9                                    
V     9                                    
W     3                                    
Y     6                                    

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 27202 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 27203 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 27204 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 27205 T 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 27206 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 27207 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 27208 C 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 27209 A 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 27210 T 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 27211 C 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 27212 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 27213 C 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 27214 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 27215 T 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 27216 T 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 27217 G 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 27218 A 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 27219 C 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 27220 T 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 27221 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 27222 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 27223 C 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 27224 A 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 27225 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 27226 G 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 27227 T 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 27228 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 27229 A 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 27230 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 27231 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 27232 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 27233 T 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 27234 A 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 27235 G 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 27236 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 27237 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 27238 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 27239 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 27240 G 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 27241 A 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 27242 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 27243 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 27244 T 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 27245 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 27246 A 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 27247 C 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 27248 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 27249 A 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 27250 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 27251 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 27252 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 27253 A 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 27254 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 27255 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 27256 A 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 27257 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 27258 G 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 27259 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 27260 G 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 27261 G 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 27262 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 27263 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 27264 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 27265 T 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 27266 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 27267 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 27268 A 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 27269 A 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 27270 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 27271 G 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 27272 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 27273 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 27274 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 27275 C 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 27276 C 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 27277 A 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 27278 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 27279 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 27280 T 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 27281 G 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 27282 G 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 27283 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 27284 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 27285 T 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 27286 C 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 27287 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 27288 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 27289 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 27290 A 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 27291 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 27292 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 27293 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 27294 C 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 27295 A 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 27296 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 27297 C 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 27298 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 27299 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 27300 A 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 27301 A 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 27302 A 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 27303 C 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 27304 C 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 27305 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 27306 C 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 27307 A 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 27308 T 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 27309 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 27310 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 27311 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 27312 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 27313 A 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 27314 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 27315 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 27316 A 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 27317 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 27318 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 27319 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 27320 T 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 27321 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 27322 T 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 27323 C 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 27324 T 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 27325 A 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 27326 A 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 27327 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 27328 T 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 27329 C 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 27330 A 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 27331 C 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 27332 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 27333 A 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 27334 A 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 27335 C 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 27336 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 27337 G 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 27338 A 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 27339 G 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 27340 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 27341 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 27342 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 27343 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 27344 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 27345 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 27346 T 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 27347 A 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 27348 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 27349 T 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 27350 C 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 27351 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 27352 C 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 27353 A 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 27354 A 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 27355 T 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 27356 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 27357 A 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 27358 G 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 27359 A 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 27360 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 27361 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 27362 A 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 27363 A 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 27364 G 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 27365 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 27366 G 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 27367 C 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 27368 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 27369 A 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 27370 C 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 27371 C 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 27372 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 27373 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 27374 T 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 27375 G 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 27376 G 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 27377 A 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 27378 G 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 27379 A 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 27380 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 27381 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 27382 G 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 27383 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 27384 T 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 27385 T 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 27386 A 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 27387 A 1 1