National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V Y
*     33                                      
-     488                                      
?                                            
A     3                                      
C     21                                      
D     3                                      
E     9                                      
F     15                                      
G     12                                      
H     12                                      
I     51                                      
K     36                                      
L     94                                      
M     18                                      
N     19                                      
P     3                                      
Q     30                                      
R     18                                      
S     24                                      
T     24                                      
V     45                                      
Y     18                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 20659 T 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 20660 C 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 20661 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 20662 A 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 20663 G 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 20664 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 20665 C 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 20666 A 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 20667 A 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 20668 G 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 20669 C 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 20670 G 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 20671 T 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 20672 G 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 20673 G 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 20674 C 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 20675 A 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 20676 A 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 20677 C 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 20678 C 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 20679 G 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 20680 G 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 20681 G 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 20682 T 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 20683 G 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 20684 T 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 20685 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 20686 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 20687 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 20688 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 20689 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 20690 T 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 20691 G 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 20692 C 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 20693 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 20694 T 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 20695 A 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 20696 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 20697 T 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 20698 C 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 20699 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 20700 T 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 20701 T 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 20702 A 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 20703 C 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 20704 A 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 20705 A 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 20706 A 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 20707 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 20708 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 20709 G 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 20710 C 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 20711 A 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 20712 A 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 20713 A 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 20714 G 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 20715 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 20716 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 20717 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 20718 G 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 20719 C 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 20720 T 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 20721 A 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 20722 T 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 20723 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 20724 A 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 20725 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 20726 A 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 20727 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 20728 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 20729 A 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 20730 G 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 20731 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 20732 G 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 20733 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 20734 G 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 20735 A 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 20736 C 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 20737 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 20738 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 20739 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 20740 C 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 20741 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 20742 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 20743 A 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 20744 A 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 20745 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 20746 T 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 20747 A 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 20748 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 20749 G 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 20750 G 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 20751 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 20752 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 20753 A 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 20754 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 20755 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 20756 G 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 20757 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 20758 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 20759 C 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 20760 A 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 20761 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 20762 C 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 20763 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 20764 T 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 20765 T 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 20766 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 20767 C 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 20768 C 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 20769 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 20770 A 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 20771 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 20772 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 20773 G 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 20774 G 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 20775 C 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 20776 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 20777 T 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 20778 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 20779 A 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 20780 T 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 20781 G 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 20782 A 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 20783 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 20784 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 20785 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 20786 A 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 20787 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 20788 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 20789 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 20790 C 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 20791 G 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 20792 C 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 20793 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 20794 A 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 20795 A 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 20796 A 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 20797 T 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 20798 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 20799 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 20800 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 20801 C 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 20802 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 20803 C 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 20804 A 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 20805 A 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 20806 C 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 20807 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 20808 G 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 20809 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 20810 G 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 20811 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 20812 C 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 20813 A 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 20814 A 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 20815 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 20816 A 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 20817 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 20818 T 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 20819 T 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 20820 A 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 20821 A 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 20822 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 20823 C 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 20824 A 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 20825 C 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 20826 A 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 20827 T 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 20828 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 20829 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 20830 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 20831 C 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 20832 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 20833 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 20834 T 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 20835 A 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 20836 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 20837 C 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 20838 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 20839 G 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 20840 T 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 20841 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 20842 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 20843 C 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 20844 C 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 20845 T 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 20846 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 20847 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 20848 A 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 20849 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 20850 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 20851 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 20852 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 20853 G 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 20854 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 20855 G 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 20856 A 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 20857 G 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 20858 T 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 20859 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 20860 A 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 20861 T 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 20862 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 20863 C 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 20864 A 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 20865 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 20866 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 20867 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 20868 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 20869 G 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 20870 G 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 20871 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 20872 G 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 20873 C 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 20874 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 20875 G 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 20876 G 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 20877 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 20878 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 20879 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 20880 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 20881 G 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 20882 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 20883 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 20884 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 20885 A 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 20886 A 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 20887 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 20888 G 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 20889 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 20890 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 20891 T 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 20892 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 20893 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 20894 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 20895 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 20896 C 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 20897 C 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 20898 A 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 20899 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 20900 G 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 20901 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 20902 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 20903 C 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 20904 A 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 20905 G 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 20906 C 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 20907 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 20908 G 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 20909 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 20910 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 20911 T 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 20912 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 20913 A 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 20914 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 20915 G 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 20916 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 20917 C 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 20918 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 20919 G 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 20920 T 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 20921 G 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 20922 G 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 20923 T 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 20924 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 20925 G 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 20926 C 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 20927 C 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 20928 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 20929 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 20930 C 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 20931 G 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 20932 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 20933 G 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 20934 T 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 20935 A 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 20936 C 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 20937 G 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 20938 C 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 20939 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 20940 G 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 20941 C 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 20942 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 20943 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 20944 G 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 20945 T 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 20946 C 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 20947 G 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 20948 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 20949 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 20950 T 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 20951 C 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 20952 A 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 20953 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 20954 A 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 20955 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 20956 C 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 20957 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 20958 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 20959 A 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 20960 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 20961 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 20962 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 20963 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 20964 C 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 20965 T 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 20966 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 20967 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 20968 G 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 20969 T 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 20970 C 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 20971 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 20972 C 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 20973 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 20974 G 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 20975 A 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 20976 T 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 20977 G 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 20978 C 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 20979 A 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 20980 G 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 20981 A 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 20982 T 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 20983 T 1 1
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328 Antigua_and_Barbuda 20987 C 1 1
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