National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     63                                        
-     894                                        
?                                              
A     9                                        
C     30                                        
D     12                                        
E     18                                        
F     42                                        
G     30                                        
H     27                                        
I     81                                        
K     57                                        
L     174                                        
M     42                                        
N     34                                        
P     15                                        
Q     45                                        
R     24                                        
S     42                                        
T     44                                        
V     72                                        
W     6                                        
Y     27                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Andorra 20659 T 1 1
1 Andorra 20660 C 1 1
2 Andorra 20661 T 1 1
3 Andorra 20662 A 1 1
4 Andorra 20663 G 1 1
5 Andorra 20664 T 1 1
6 Andorra 20665 C 1 1
7 Andorra 20666 A 1 1
8 Andorra 20667 A 1 1
9 Andorra 20668 G 1 1
10 Andorra 20669 C 1 1
11 Andorra 20670 G 1 1
12 Andorra 20671 T 1 1
13 Andorra 20672 G 1 1
14 Andorra 20673 G 1 1
15 Andorra 20674 C 1 1
16 Andorra 20675 A 1 1
17 Andorra 20676 A 1 1
18 Andorra 20677 C 1 1
19 Andorra 20678 C 1 1
20 Andorra 20679 G 1 1
21 Andorra 20680 G 1 1
22 Andorra 20681 G 1 1
23 Andorra 20682 T 1 1
24 Andorra 20683 G 1 1
25 Andorra 20684 T 1 1
26 Andorra 20685 T 1 1
27 Andorra 20686 G 1 1
28 Andorra 20687 C 1 1
29 Andorra 20688 T 1 1
30 Andorra 20689 A 1 1
31 Andorra 20690 T 1 1
32 Andorra 20691 G 1 1
33 Andorra 20692 C 1 1
34 Andorra 20693 C 1 1
35 Andorra 20694 T 1 1
36 Andorra 20695 A 1 1
37 Andorra 20696 A 1 1
38 Andorra 20697 T 1 1
39 Andorra 20698 C 1 1
40 Andorra 20699 T 1 1
41 Andorra 20700 T 1 1
42 Andorra 20701 T 1 1
43 Andorra 20702 A 1 1
44 Andorra 20703 C 1 1
45 Andorra 20704 A 1 1
46 Andorra 20705 A 1 1
47 Andorra 20706 A 1 1
48 Andorra 20707 A 1 1
49 Andorra 20708 T 1 1
50 Andorra 20709 G 1 1
51 Andorra 20710 C 1 1
52 Andorra 20711 A 1 1
53 Andorra 20712 A 1 1
54 Andorra 20713 A 1 1
55 Andorra 20714 G 1 1
56 Andorra 20715 A 1 1
57 Andorra 20716 A 1 1
58 Andorra 20717 T 1 1
59 Andorra 20718 G 1 1
60 Andorra 20719 C 1 1
61 Andorra 20720 T 1 1
62 Andorra 20721 A 1 1
63 Andorra 20722 T 1 1
64 Andorra 20723 T 1 1
65 Andorra 20724 A 1 1
66 Andorra 20725 G 1 1
67 Andorra 20726 A 1 1
68 Andorra 20727 A 1 1
69 Andorra 20728 A 1 1
70 Andorra 20729 A 1 1
71 Andorra 20730 G 1 1
72 Andorra 20731 T 1 1
73 Andorra 20732 G 1 1
74 Andorra 20733 T 1 1
75 Andorra 20734 G 1 1
76 Andorra 20735 A 1 1
77 Andorra 20736 C 1 1
78 Andorra 20737 C 1 1
79 Andorra 20738 T 1 1
80 Andorra 20739 T 1 1
81 Andorra 20740 C 1 1
82 Andorra 20741 A 1 1
83 Andorra 20742 A 1 1
84 Andorra 20743 A 1 1
85 Andorra 20744 A 1 1
86 Andorra 20745 T 1 1
87 Andorra 20746 T 1 1
88 Andorra 20747 A 1 1
89 Andorra 20748 T 1 1
90 Andorra 20749 G 1 1
91 Andorra 20750 G 1 1
92 Andorra 20751 T 1 1
93 Andorra 20752 G 1 1
94 Andorra 20753 A 1 1
95 Andorra 20754 T 1 1
96 Andorra 20755 A 1 1
97 Andorra 20756 G 1 1
98 Andorra 20757 T 1 1
99 Andorra 20758 G 1 1
100 Andorra 20759 C 1 1
101 Andorra 20760 A 1 1
102 Andorra 20761 A 1 1
103 Andorra 20762 C 1 1
104 Andorra 20763 A 1 1
105 Andorra 20764 T 1 1
106 Andorra 20765 T 1 1
107 Andorra 20766 A 1 1
108 Andorra 20767 C 1 1
109 Andorra 20768 C 1 1
110 Andorra 20769 T 1 1
111 Andorra 20770 A 1 1
112 Andorra 20771 A 1 1
113 Andorra 20772 A 1 1
114 Andorra 20773 G 1 1
115 Andorra 20774 G 1 1
116 Andorra 20775 C 1 1
117 Andorra 20776 A 1 1
118 Andorra 20777 T 1 1
119 Andorra 20778 A 1 1
120 Andorra 20779 A 1 1
121 Andorra 20780 T 1 1
122 Andorra 20781 G 1 1
123 Andorra 20782 A 1 1
124 Andorra 20783 T 1 1
125 Andorra 20784 G 1 1
126 Andorra 20785 A 1 1
127 Andorra 20786 A 1 1
128 Andorra 20787 T 1 1
129 Andorra 20788 G 1 1
130 Andorra 20789 T 1 1
131 Andorra 20790 C 1 1
132 Andorra 20791 G 1 1
133 Andorra 20792 C 1 1
134 Andorra 20793 A 1 1
135 Andorra 20794 A 1 1
136 Andorra 20795 A 1 1
137 Andorra 20796 A 1 1
138 Andorra 20797 T 1 1
139 Andorra 20798 A 1 1
140 Andorra 20799 T 1 1
141 Andorra 20800 A 1 1
142 Andorra 20801 C 1 1
143 Andorra 20802 T 1 1
144 Andorra 20803 C 1 1
145 Andorra 20804 A 1 1
146 Andorra 20805 A 1 1
147 Andorra 20806 C 1 1
148 Andorra 20807 T 1 1
149 Andorra 20808 G 1 1
150 Andorra 20809 T 1 1
151 Andorra 20810 G 1 1
152 Andorra 20811 T 1 1
153 Andorra 20812 C 1 1
154 Andorra 20813 A 1 1
155 Andorra 20814 A 1 1
156 Andorra 20815 T 1 1
157 Andorra 20816 A 1 1
158 Andorra 20817 T 1 1
159 Andorra 20818 T 1 1
160 Andorra 20819 T 1 1
161 Andorra 20820 A 1 1
162 Andorra 20821 A 1 1
163 Andorra 20822 A 1 1
164 Andorra 20823 C 1 1
165 Andorra 20824 A 1 1
166 Andorra 20825 C 1 1
167 Andorra 20826 A 1 1
168 Andorra 20827 T 1 1
169 Andorra 20828 T 1 1
170 Andorra 20829 A 1 1
171 Andorra 20830 A 1 1
172 Andorra 20831 C 1 1
173 Andorra 20832 A 1 1
174 Andorra 20833 T 1 1
175 Andorra 20834 T 1 1
176 Andorra 20835 A 1 1
177 Andorra 20836 G 1 1
178 Andorra 20837 C 1 1
179 Andorra 20838 T 1 1
180 Andorra 20839 G 1 1
181 Andorra 20840 T 1 1
182 Andorra 20841 A 1 1
183 Andorra 20842 C 1 1
184 Andorra 20843 C 1 1
185 Andorra 20844 C 1 1
186 Andorra 20845 T 1 1
187 Andorra 20846 A 1 1
188 Andorra 20847 T 1 1
189 Andorra 20848 A 1 1
190 Andorra 20849 A 1 1
191 Andorra 20850 T 1 1
192 Andorra 20851 A 1 1
193 Andorra 20852 T 1 1
194 Andorra 20853 G 1 1
195 Andorra 20854 A 1 1
196 Andorra 20855 G 1 1
197 Andorra 20856 A 1 1
198 Andorra 20857 G 1 1
199 Andorra 20858 T 1 1
200 Andorra 20859 T 1 1
201 Andorra 20860 A 1 1
202 Andorra 20861 T 1 1
203 Andorra 20862 A 1 1
204 Andorra 20863 C 1 1
205 Andorra 20864 A 1 1
206 Andorra 20865 T 1 1
207 Andorra 20866 T 1 1
208 Andorra 20867 T 1 1
209 Andorra 20868 T 1 1
210 Andorra 20869 G 1 1
211 Andorra 20870 G 1 1
212 Andorra 20871 T 1 1
213 Andorra 20872 G 1 1
214 Andorra 20873 C 1 1
215 Andorra 20874 T 1 1
216 Andorra 20875 G 1 1
217 Andorra 20876 G 1 1
218 Andorra 20877 T 1 1
219 Andorra 20878 T 1 1
220 Andorra 20879 C 1 1
221 Andorra 20880 T 1 1
222 Andorra 20881 G 1 1
223 Andorra 20882 A 1 1
224 Andorra 20883 T 1 1
225 Andorra 20884 A 1 1
226 Andorra 20885 A 1 1
227 Andorra 20886 A 1 1
228 Andorra 20887 G 1 1
229 Andorra 20888 G 1 1
230 Andorra 20889 A 1 1
231 Andorra 20890 G 1 1
232 Andorra 20891 T 1 1
233 Andorra 20892 T 1 1
234 Andorra 20893 G 1 1
235 Andorra 20894 C 1 1
236 Andorra 20895 A 1 1
237 Andorra 20896 C 1 1
238 Andorra 20897 C 1 1
239 Andorra 20898 A 1 1
240 Andorra 20899 G 1 1
241 Andorra 20900 G 1 1
242 Andorra 20901 T 1 1
243 Andorra 20902 A 1 1
244 Andorra 20903 C 1 1
245 Andorra 20904 A 1 1
246 Andorra 20905 G 1 1
247 Andorra 20906 C 1 1
248 Andorra 20907 T 1 1
249 Andorra 20908 G 1 1
250 Andorra 20909 T 1 1
251 Andorra 20910 T 1 1
252 Andorra 20911 T 1 1
253 Andorra 20912 T 1 1
254 Andorra 20913 A 1 1
255 Andorra 20914 A 1 1
256 Andorra 20915 G 1 1
257 Andorra 20916 A 1 1
258 Andorra 20917 C 1 1
259 Andorra 20918 A 1 1
260 Andorra 20919 G 1 1
261 Andorra 20920 T 1 1
262 Andorra 20921 G 1 1
263 Andorra 20922 G 1 1
264 Andorra 20923 T 1 1
265 Andorra 20924 T 1 1
266 Andorra 20925 G 1 1
267 Andorra 20926 C 1 1
268 Andorra 20927 C 1 1
269 Andorra 20928 T 1 1
270 Andorra 20929 A 1 1
271 Andorra 20930 C 1 1
272 Andorra 20931 G 1 1
273 Andorra 20932 G 1 1
274 Andorra 20933 G 1 1
275 Andorra 20934 T 1 1
276 Andorra 20935 A 1 1
277 Andorra 20936 C 1 1
278 Andorra 20937 G 1 1
279 Andorra 20938 C 1 1
280 Andorra 20939 T 1 1
281 Andorra 20940 G 1 1
282 Andorra 20941 C 1 1
283 Andorra 20942 T 1 1
284 Andorra 20943 T 1 1
285 Andorra 20944 G 1 1
286 Andorra 20945 T 1 1
287 Andorra 20946 C 1 1
288 Andorra 20947 G 1 1
289 Andorra 20948 A 1 1
290 Andorra 20949 T 1 1
291 Andorra 20950 T 1 1
292 Andorra 20951 C 1 1
293 Andorra 20952 A 1 1
294 Andorra 20953 G 1 1
295 Andorra 20954 A 1 1
296 Andorra 20955 T 1 1
297 Andorra 20956 C 1 1
298 Andorra 20957 T 1 1
299 Andorra 20958 T 1 1
300 Andorra 20959 A 1 1
301 Andorra 20960 A 1 1
302 Andorra 20961 T 1 1
303 Andorra 20962 G 1 1
304 Andorra 20963 A 1 1
305 Andorra 20964 C 1 1
306 Andorra 20965 T 1 1
307 Andorra 20966 T 1 1
308 Andorra 20967 T 1 1
309 Andorra 20968 G 1 1
310 Andorra 20969 T 1 1
311 Andorra 20970 C 1 1
312 Andorra 20971 T 1 1
313 Andorra 20972 C 1 1
314 Andorra 20973 T 1 1
315 Andorra 20974 G 1 1
316 Andorra 20975 A 1 1
317 Andorra 20976 T 1 1
318 Andorra 20977 G 1 1
319 Andorra 20978 C 1 1
320 Andorra 20979 A 1 1
321 Andorra 20980 G 1 1
322 Andorra 20981 A 1 1
323 Andorra 20982 T 1 1
324 Andorra 20983 T 1 1
325 Andorra 20984 C 1 1
326 Andorra 20985 A 1 1
327 Andorra 20986 A 1 1
328 Andorra 20987 C 1 1
329 Andorra 20988 T 1 1
330 Andorra 20989 T 1 1
331 Andorra 20990 T 1 1
332 Andorra 20991 G 1 1
333 Andorra 20992 A 1 1
334 Andorra 20993 T 1 1
335 Andorra 20994 T 1 1
336 Andorra 20995 G 1 1
337 Andorra 20996 G 1 1
338 Andorra 20997 T 1 1
339 Andorra 20998 G 1 1
340 Andorra 20999 A 1 1
341 Andorra 21000 T 1 1
342 Andorra 21001 T 1 1
343 Andorra 21002 G 1 1
344 Andorra 21003 T 1 1
345 Andorra 21004 G 1 1
346 Andorra 21005 C 1 1
347 Andorra 21006 A 1 1
348 Andorra 21007 A 1 1
349 Andorra 21008 C 1 1
350 Andorra 21009 T 1 1
351 Andorra 21010 G 1 1
352 Andorra 21011 T 1 1
353 Andorra 21012 A 1 1
354 Andorra 21013 C 1 1
355 Andorra 21014 A 1 1
356 Andorra 21015 T 1 1
357 Andorra 21016 A 1 1
358 Andorra 21017 C 1 1
359 Andorra 21018 A 1 1
360 Andorra 21019 G 1 1
361 Andorra 21020 C 1 1
362 Andorra 21021 T 1 1
363 Andorra 21022 A 1 1
364 Andorra 21023 A 1 1
365 Andorra 21024 T 1 1
366 Andorra 21025 A 1 1
367 Andorra 21026 A 1 1
368 Andorra 21027 A 1 1
369 Andorra 21028 T 1 1
370 Andorra 21029 G 1 1
371 Andorra 21030 G 1 1
372 Andorra 21031 G 1 1
373 Andorra 21032 A 1 1
374 Andorra 21033 T 1 1
375 Andorra 21034 C 1 1
376 Andorra 21035 T 1 1
377 Andorra 21036 C 1 1
378 Andorra 21037 A 1 1
379 Andorra 21038 T 1 1
380 Andorra 21039 T 1 1
381 Andorra 21040 A 1 1
382 Andorra 21041 T 1 1
383 Andorra 21042 T 1 1
384 Andorra 21043 A 1 1
385 Andorra 21044 G 1 1
386 Andorra 21045 T 1 1
387 Andorra 21046 G 1 1
388 Andorra 21047 A 1 1
389 Andorra 21048 T 1 1
390 Andorra 21049 A 1 1
391 Andorra 21050 T 1 1
392 Andorra 21051 G 1 1
393 Andorra 21052 T 1 1
394 Andorra 21053 A 1 1
395 Andorra 21054 C 1 1
396 Andorra 21055 G 1 1
397 Andorra 21056 A 1 1
398 Andorra 21057 C 1 1
399 Andorra 21058 C 1 1
400 Andorra 21059 C 1 1
401 Andorra 21060 T 1 1
402 Andorra 21061 A 1 1
403 Andorra 21062 A 1 1
404 Andorra 21063 G 1 1
405 Andorra 21064 A 1 1
406 Andorra 21065 C 1 1
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860 Andorra 21519 A 1 1
861 Andorra 21520 G 1 1
862 Andorra 21521 T 1 1
863 Andorra 21522 T 1 1
864 Andorra 21523 G 1 1
865 Andorra 21524 T 1 1
866 Andorra 21525 T 1 1
867 Andorra 21526 A 1 1
868 Andorra 21527 T 1 1
869 Andorra 21528 T 1 1
870 Andorra 21529 T 1 1
871 Andorra 21530 C 1 1
872 Andorra 21531 T 1 1
873 Andorra 21532 A 1 1
874 Andorra 21533 G 1 1
875 Andorra 21534 T 1 1
876 Andorra 21535 G 1 1
877 Andorra 21536 A 1 1
878 Andorra 21537 T 1 1
879 Andorra 21538 G 1 1
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883 Andorra 21542 T 1 1
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888 Andorra 21547 A 1 1
889 Andorra 21548 A 1 1
890 Andorra 21549 C 1 1
891 Andorra 21550 A 1 1
892 Andorra 21551 A 1 1
893 Andorra 21552 C 1 1