معاونت فناوري پژوهشگاه با هدف ايجاد بستر مناسب براي توسعه، عرضه و تجاري سازي فناوريهاي زيستي مبتني بر نيازهاي جامعه، داراي زير مجموعه هاي مرکزتوسعه فناوري هاي زيستي، مرکز خدمات تخصصی زیست فناوری، مديريت تجاري سازي، ارتباط با صنعت و کارآفريني و گروه مالکيت فکري است. اهم وظايف این واحدها آن به شرح زير ميباشد: